list_data_files
Lists analysis-ready files in a data folder by extension, returning absolute paths for direct parsing. Optionally includes raw instrument files when broader discovery is needed.
Instructions
データフォルダにある解析対象ファイルを拡張子別に一覧します。
directory: 探索するフォルダ。省略時は既定のデータディレクトリ (環境変数 LIPIDMIX_DATA_DIR または /data)。
extension: 指定するとその拡張子だけに絞る(例 '.pai2', '.arf2', '.EIC.aef')。
all_files: 既定では解析できる拡張子 (.arf / .arf2 / .pai2 / .dcl / .EIC.aef / .mddata / .mdproject) だけを返す。 測定生データ(MS-DIAL が読む .abf / .ibf / .cdf / .mzml / .wiff / .raw / .d / .wiff2 / .qgd / .lcd / .lrp / .imzml)まで見たいときだけ True にする。 Agilent・Bruker の .d と Waters の .raw はフォルダが 1 検体なので、 末尾に
/を付けて示す。
返すのは絶対パスで、pai2_parser(file_path=...) 等へそのまま渡せる。
フォルダ全体をまず解析するなら load_dataset(directory) が入口。
Input Schema
| Name | Required | Description | Default |
|---|---|---|---|
| all_files | No | ||
| directory | No | ||
| extension | No |