dataset_pca
Runs PCA on preprocessed lipidomics data to reduce dimensionality and stores loadings for downstream analysis; preprocess the dataset first.
Instructions
前処理済み DatasetState に PCA を実行する。
dataset_preprocess を先に実行しておくこと。 n_components: 主成分数(既定 5。サンプル数・特徴量数の小さい方で上限が決まる)。 log_transform: 標準化の前に log10 変換を適用する(既定 False)。
ローディング全量は戻り値に載せず session.dataset.last_pca に保持する。
Input Schema
| Name | Required | Description | Default |
|---|---|---|---|
| n_components | No | ||
| log_transform | No |