⚠️ Важное уведомление : этот репозиторий больше не поддерживается. Пожалуйста, посетите SCMCPHub для получения последней версии серверов MCP.
СКМКП
MCP-сервер для анализа scRNA-Seq с использованием естественного языка!
🪩 Что он может делать?
- Модуль ввода-вывода, например, чтение и запись данных scRNA-Seq на естественном языке
- Модуль предварительной обработки, такой как фильтрация, контроль качества, нормализация, масштабирование, высоковариабельные гены, PCA, соседи,...
- Модуль инструментов, такой как кластеризация, дифференциальное выражение и т. д.
- Модуль построения графиков, например, скрипка, тепловая карта, точечный график
- анализ межклеточной коммуникации
❓ Для кого это?
- Всем, кто хочет провести анализ scRNA-Seq на естественном языке!
- Разработчики агентов, которые хотят вызывать функции scanpy для своих приложений
🌐 Где это использовать?
Вы можете использовать scmcp в большинстве клиентов ИИ, плагинов или фреймворков агентов, которые поддерживают MCP:
- Клиенты ИИ, такие как Cherry Studio
- Плагины, такие как Cline
- Агентские фреймворки, такие как Agno
🎬 Демо
Демонстрация, демонстрирующая анализ кластеров клеток scRNA-Seq в клиенте ИИ Cherry Studio с использованием естественного языка на основе scmcp
https://github.com/user-attachments/assets/93a8fcd8-aa38-4875-a147-a5eeff22a559
🏎️ Быстрый старт
Установить
Установить из PyPI
Вы можете проверить это, запустив
запустить scnapy-server локально
Ознакомьтесь со следующей конфигурацией в вашем клиенте MCP:
запустить scnapy-server удаленно
Ознакомьтесь со следующей конфигурацией в вашем клиенте MCP:
запустите его на своем сервере
Затем настройте свой MCP-клиент следующим образом:
🤝 Вклад
Если у вас есть вопросы, добро пожаловать, чтобы отправить сообщение об ошибке или связаться со мной ( hsh-me@outlook.com ). Вклад в код также приветствуется!
You must be authenticated.
hybrid server
The server is able to function both locally and remotely, depending on the configuration or use case.
Сервер MCP, который позволяет проводить анализ последовательности РНК отдельных клеток с помощью естественного языка, поддерживая задачи обработки, визуализации и анализа данных без необходимости знания кодирования.
Related MCP Servers
- -securityAlicense-qualityAn MCP server that enables language models to fetch protein information from the UniProt database, including protein details, sequences, functions, and structures.Last updated -PythonMIT License
- AsecurityFlicenseAqualityAn MCP server that provides comprehensive Excel file operations, data analysis, and visualization capabilities for working with various spreadsheet formats like XLSX, CSV, and JSON.Last updated -836Python
- -securityAlicense-qualityAn MCP server that enables access to clinical evidence from the CIViC database, allowing users to search across variants, diseases, drugs, and phenotypes to support precision oncology research.Last updated -43PythonMIT License
- AsecurityAlicenseAqualityAn open-source MCP server that connects to various data sources (SQL databases, CSV, Parquet files), allowing AI models to execute SQL queries and generate data visualizations for analytics and business intelligence.Last updated -1032PythonMIT License