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SCMCP

by huang-sh
GitHub
Python
BSD 3-Clause
10
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SCMCP

자연어를 활용한 scRNA-Seq 분석을 위한 MCP 서버!

🪩 무엇을 할 수 있나요?

  • 자연어로 scRNA-Seq 데이터를 읽고 쓰는 IO 모듈
  • 필터링, 품질 관리, 정규화, 스케일링, 고변동 유전자, PCA, 이웃 등과 같은 전처리 모듈입니다.
  • 클러스터링, 차등 표현 등과 같은 도구 모듈
  • 바이올린, 히트맵, 도트플롯과 같은 플로팅 모듈
  • 세포 간 소통 분석

❓ 누구를 위한 것인가요?

  • scRNA-Seq 분석을 자연어로 하고 싶은 사람!
  • 자신의 애플리케이션에 대해 Scanpy의 함수를 호출하려는 에이전트 개발자

🌐 어디에 사용하나요?

MCP를 지원하는 대부분의 AI 클라이언트, 플러그인 또는 에이전트 프레임워크에서 scmcp를 사용할 수 있습니다.

  • Cherry Studio와 같은 AI 클라이언트
  • Cline과 같은 플러그인
  • Agno와 같은 에이전트 프레임워크

🎬 데모

scmcp 기반 자연어를 사용하여 AI 클라이언트 Cherry Studio에서 scRNA-Seq 세포 클러스터 분석을 보여주는 데모

https://github.com/user-attachments/assets/93a8fcd8-aa38-4875-a147-a5eeff22a559

🏎️ 빠른 시작

설치하다

PyPI에서 설치

지엑스피1

실행하여 테스트할 수 있습니다

scmcp run
로컬에서 scnapy-server를 실행하세요

MCP 클라이언트에서 다음 구성을 참조하세요.

"mcpServers": { "scmcp": { "command": "scmcp", "args": [ "run" ] } }
원격으로 scnapy-server 실행

MCP 클라이언트에서 다음 구성을 참조하세요.

서버에서 실행하세요

scmcp run --transport sse --port 8000

그런 다음 다음과 같이 MCP 클라이언트를 구성하세요.

http://localhost:8000/sse

🤝 기여하기

궁금한 점이 있으시면 언제든지 문제를 제출하시거나 저에게 연락해 주세요( hsh-me@outlook.com ). 코드에 기여해 주시는 것도 환영합니다!

Install Server
A
security – no known vulnerabilities
A
license - permissive license
A
quality - confirmed to work

How are these scores calculated?

hybrid server

The server is able to function both locally and remotely, depending on the configuration or use case.

자연어를 통해 단일 세포 RNA 시퀀싱 분석을 가능하게 하는 MCP 서버로, 코딩 지식이 필요 없이 데이터 처리, 시각화 및 분석 작업을 지원합니다.

  1. 🪩 무엇을 할 수 있나요?
    1. ❓ 누구를 위한 것인가요?
      1. 🌐 어디에 사용하나요?
        1. 🎬 데모
          1. 🏎️ 빠른 시작
            1. 설치하다
          2. 🤝 기여하기

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