顺势疗法
使用自然语言进行 scRNA-Seq 分析的 MCP 服务器!
🪩 它能做什么?
- IO 模块,例如使用自然语言读取和写入 scRNA-Seq 数据
- 预处理模块,如过滤、质量控制、标准化、缩放、高度可变基因、PCA、邻居等。
- 工具模块,如聚类、差异表达等。
- 绘图模块,例如小提琴图、热图、点图
- 细胞间通讯分析
❓ 这是给谁的?
- 任何想要进行 scRNA-Seq 分析自然语言的人!
- 想要为其应用程序调用 scanpy 函数的代理开发人员
🌐 在哪里使用它?
您可以在大多数支持 MCP 的 AI 客户端、插件或代理框架中使用 scmcp:
- AI客户端,例如Cherry Studio
- 插件,例如 Cline
- 代理框架,例如 Agno
🎬 演示
演示 AI 客户端 Cherry Studio 中使用基于 scmcp 的自然语言进行 scRNA-Seq 细胞聚类分析
https://github.com/user-attachments/assets/93a8fcd8-aa38-4875-a147-a5eeff22a559
🏎️ 快速入门
安装
从 PyPI 安装
你可以通过运行来测试它
在本地运行 scnapy-server
在您的 MCP 客户端中参考以下配置:
远程运行 scnapy-server
在您的 MCP 客户端中参考以下配置:
在您的服务器上运行它
然后配置您的 MCP 客户端,如下所示:
🤝 贡献
如有任何疑问,欢迎提交 issue,或联系我 ( hsh-me@outlook.com )。也欢迎您为代码做出贡献!
hybrid server
The server is able to function both locally and remotely, depending on the configuration or use case.
一种 MCP 服务器,可通过自然语言进行单细胞 RNA 测序分析,支持数据处理、可视化和分析任务,而无需编码知识。
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