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SCMCP
Ein MCP-Server für die scRNA-Seq-Analyse mit natürlicher Sprache!
🪩 Was kann es?
- IO-Modul wie Lesen und Schreiben von scRNA-Seq-Daten mit natürlicher Sprache
- Vorverarbeitungsmodul, wie Filterung, Qualitätskontrolle, Normalisierung, Skalierung, hochvariable Gene, PCA, Nachbarn, …
- Werkzeugmodul, wie Clustering, differentieller Ausdruck usw.
- Plotmodul, wie Violine, Heatmap, Punktdiagramm
- Analyse der Zell-Zell-Kommunikation
❓ Für wen ist das?
- Jeder, der scRNA-Seq-Analysen in natürlicher Sprache durchführen möchte!
- Agentenentwickler, die Scanpy-Funktionen für ihre Anwendungen aufrufen möchten
🌐 Wo kann man es verwenden?
Sie können scmcp in den meisten KI-Clients, Plugins oder Agent-Frameworks verwenden, die MCP unterstützen:
- KI-Clients wie Cherry Studio
- Plugins wie Cline
- Agenten-Frameworks wie Agno
🎬 Demo
Eine Demo, die die scRNA-Seq-Zellclusteranalyse in einem KI-Client Cherry Studio unter Verwendung natürlicher Sprache basierend auf scmcp zeigt
https://github.com/user-attachments/assets/93a8fcd8-aa38-4875-a147-a5eeff22a559
🏎️ Schnellstart
Installieren
Von PyPI installieren
Sie können es testen, indem Sie ausführen
Führen Sie scanpy-server lokal aus
Beachten Sie die folgende Konfiguration in Ihrem MCP-Client:
Führen Sie den Scanpy-Server remote aus
Beachten Sie die folgende Konfiguration in Ihrem MCP-Client:
Führen Sie es auf Ihrem Server aus
Konfigurieren Sie dann Ihren MCP-Client wie folgt:
🤝 Beitragen
Bei Fragen können Sie uns gerne ein Problem melden oder mich kontaktieren ( hsh-me@outlook.com ). Auch Codebeiträge sind willkommen!
hybrid server
The server is able to function both locally and remotely, depending on the configuration or use case.
Ein MCP-Server, der die Analyse der RNA-Sequenzierung einzelner Zellen mithilfe natürlicher Sprache ermöglicht und Datenverarbeitungs-, Visualisierungs- und Analyseaufgaben unterstützt, ohne dass Programmierkenntnisse erforderlich sind.
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