Skip to main content
Glama

⚠️ Wichtiger Hinweis : Dieses Repository wird nicht mehr gepflegt. Bitte besuchen Sie SCMCPHub für die neueste Version der MCP-Server.

SCMCP

Ein MCP-Server für die scRNA-Seq-Analyse mit natürlicher Sprache!

🪩 Was kann es?

  • IO-Modul wie Lesen und Schreiben von scRNA-Seq-Daten mit natürlicher Sprache

  • Vorverarbeitungsmodul, wie Filterung, Qualitätskontrolle, Normalisierung, Skalierung, hochvariable Gene, PCA, Nachbarn, …

  • Werkzeugmodul, wie Clustering, differentieller Ausdruck usw.

  • Plotmodul, wie Violine, Heatmap, Punktdiagramm

  • Analyse der Zell-Zell-Kommunikation

Related MCP server: Zanny's Persistent Memory Manager

❓ Für wen ist das?

  • Jeder, der scRNA-Seq-Analysen in natürlicher Sprache durchführen möchte!

  • Agentenentwickler, die Scanpy-Funktionen für ihre Anwendungen aufrufen möchten

🌐 Wo kann man es verwenden?

Sie können scmcp in den meisten KI-Clients, Plugins oder Agent-Frameworks verwenden, die MCP unterstützen:

  • KI-Clients wie Cherry Studio

  • Plugins wie Cline

  • Agenten-Frameworks wie Agno

🎬 Demo

Eine Demo, die die scRNA-Seq-Zellclusteranalyse in einem KI-Client Cherry Studio unter Verwendung natürlicher Sprache basierend auf scmcp zeigt

https://github.com/user-attachments/assets/93a8fcd8-aa38-4875-a147-a5eeff22a559

🏎️ Schnellstart

Installieren

Von PyPI installieren

pip install scmcp

Sie können es testen, indem Sie ausführen

scmcp run

Führen Sie scanpy-server lokal aus

Beachten Sie die folgende Konfiguration in Ihrem MCP-Client:

"mcpServers": { "scmcp": { "command": "scmcp", "args": [ "run" ] } }

Führen Sie den Scanpy-Server remote aus

Beachten Sie die folgende Konfiguration in Ihrem MCP-Client:

Führen Sie es auf Ihrem Server aus

scmcp run --transport sse --port 8000

Konfigurieren Sie dann Ihren MCP-Client wie folgt:

http://localhost:8000/sse

🤝 Beitragen

Bei Fragen können Sie uns gerne ein Problem melden oder mich kontaktieren ( hsh-me@outlook.com ). Auch Codebeiträge sind willkommen!

Latest Blog Posts

MCP directory API

We provide all the information about MCP servers via our MCP API.

curl -X GET 'https://glama.ai/api/mcp/v1/servers/huang-sh/scmcp'

If you have feedback or need assistance with the MCP directory API, please join our Discord server