SCMCP
自然言語による scRNA-Seq 解析のための MCP サーバーです。
🪩 何ができるの?
自然言語でscRNA-Seqデータの読み書きを行うIOモジュール
フィルタリング、品質管理、正規化、スケーリング、高度に可変的な遺伝子、PCA、近傍などの前処理モジュール。
クラスタリング、差分発現などのツール モジュール。
バイオリン、ヒートマップ、ドットプロットなどのプロットモジュール
細胞間コミュニケーション解析
❓ これは誰向けですか?
scRNA-Seq解析を自然言語でやりたい方!
アプリケーションでスキャンピーの関数を呼び出したいエージェント開発者
🌐 どこで使えますか?
MCP をサポートするほとんどの AI クライアント、プラグイン、またはエージェント フレームワークで scmcp を使用できます。
Cherry StudioのようなAIクライアント
Clineのようなプラグイン
Agnoのようなエージェントフレームワーク
🎬 デモ
scmcpに基づく自然言語を使用したAIクライアントCherry StudioでのscRNA-Seq細胞クラスター解析を示すデモ
https://github.com/user-attachments/assets/93a8fcd8-aa38-4875-a147-a5eeff22a559
🏎️ クイックスタート
インストール
PyPIからインストール
実行することでテストできます
scnapy-serverをローカルで実行する
MCP クライアントで次の構成を参照してください。
scnapy-serverをリモートで実行する
MCP クライアントで次の構成を参照してください。
サーバーで実行する
次に、MCP クライアントを次のように構成します。
🤝 貢献する
ご質問がありましたら、issue をご提出いただくか、 hsh-me@ outlook.com までご連絡ください。コードへの貢献も歓迎いたします。
hybrid server
The server is able to function both locally and remotely, depending on the configuration or use case.
Tools
自然言語による単一細胞 RNA シーケンス解析を可能にし、コーディングの知識を必要とせずにデータ処理、視覚化、および解析タスクをサポートする MCP サーバー。
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