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SCMCP

by huang-sh
GitHub
Python
BSD 3-Clause
10
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SCMCP

自然言語による scRNA-Seq 解析のための MCP サーバーです。

🪩 何ができるの？

  • 自然言語でscRNA-Seqデータの読み書きを行うIOモジュール
  • フィルタリング、品質管理、正規化、スケーリング、高度に可変的な遺伝子、PCA、近傍などの前処理モジュール。
  • クラスタリング、差分発現などのツール モジュール。
  • バイオリン、ヒートマップ、ドットプロットなどのプロットモジュール
  • 細胞間コミュニケーション解析

❓ これは誰向けですか?

  • scRNA-Seq解析を自然言語でやりたい方！
  • アプリケーションでスキャンピーの関数を呼び出したいエージェント開発者

🌐 どこで使えますか？

MCP をサポートするほとんどの AI クライアント、プラグイン、またはエージェント フレームワークで scmcp を使用できます。

  • Cherry StudioのようなAIクライアント
  • Clineのようなプラグイン
  • Agnoのようなエージェントフレームワーク

🎬 デモ

scmcpに基づく自然言語を使用したAIクライアントCherry StudioでのscRNA-Seq細胞クラスター解析を示すデモ

https://github.com/user-attachments/assets/93a8fcd8-aa38-4875-a147-a5eeff22a559

🏎️ クイックスタート

インストール

PyPIからインストール

pip install scmcp

実行することでテストできます

scmcp run
scnapy-serverをローカルで実行する

MCP クライアントで次の構成を参照してください。

"mcpServers": { "scmcp": { "command": "scmcp", "args": [ "run" ] } }
scnapy-serverをリモートで実行する

MCP クライアントで次の構成を参照してください。

サーバーで実行する

scmcp run --transport sse --port 8000

次に、MCP クライアントを次のように構成します。

http://localhost:8000/sse

🤝 貢献する

ご質問がありましたら、issue をご提出いただくか、 hsh-me@ outlook.com までご連絡ください。コードへの貢献も歓迎いたします。

Install Server
A
security – no known vulnerabilities
A
license - permissive license
A
quality - confirmed to work

How are these scores calculated?

hybrid server

The server is able to function both locally and remotely, depending on the configuration or use case.

自然言語による単一細胞 RNA シーケンス解析を可能にし、コーディングの知識を必要とせずにデータ処理、視覚化、および解析タスクをサポートする MCP サーバー。

  1. 🪩 何ができるの？
    1. ❓ これは誰向けですか?
      1. 🌐 どこで使えますか？
        1. 🎬 デモ
          1. 🏎️ クイックスタート
            1. インストール
          2. 🤝 貢献する

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