hybrid server
The server is able to function both locally and remotely, depending on the configuration or use case.
Integrations
Allows installation of the scmcp package directly from PyPI using pip, making it easy to set up the MCP server for scRNA-Seq analysis.
SCMCP
自然言語による scRNA-Seq 解析のための MCP サーバーです。
🪩 何ができるの？
- 自然言語でscRNA-Seqデータの読み書きを行うIOモジュール
- フィルタリング、品質管理、正規化、スケーリング、高度に可変的な遺伝子、PCA、近傍などの前処理モジュール。
- クラスタリング、差分発現などのツール モジュール。
- バイオリン、ヒートマップ、ドットプロットなどのプロットモジュール
- 細胞間コミュニケーション解析
❓ これは誰向けですか?
- scRNA-Seq解析を自然言語でやりたい方！
- アプリケーションでスキャンピーの関数を呼び出したいエージェント開発者
🌐 どこで使えますか？
MCP をサポートするほとんどの AI クライアント、プラグイン、またはエージェント フレームワークで scmcp を使用できます。
- Cherry StudioのようなAIクライアント
- Clineのようなプラグイン
- Agnoのようなエージェントフレームワーク
🎬 デモ
scmcpに基づく自然言語を使用したAIクライアントCherry StudioでのscRNA-Seq細胞クラスター解析を示すデモ
https://github.com/user-attachments/assets/93a8fcd8-aa38-4875-a147-a5eeff22a559
🏎️ クイックスタート
インストール
PyPIからインストール
実行することでテストできます
scnapy-serverをローカルで実行する
MCP クライアントで次の構成を参照してください。
scnapy-serverをリモートで実行する
MCP クライアントで次の構成を参照してください。
サーバーで実行する
次に、MCP クライアントを次のように構成します。
🤝 貢献する
ご質問がありましたら、issue をご提出いただくか、 hsh-me@ outlook.com までご連絡ください。コードへの貢献も歓迎いたします。
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自然言語による単一細胞 RNA シーケンス解析を可能にし、コーディングの知識を必要とせずにデータ処理、視覚化、および解析タスクをサポートする MCP サーバー。