SCMCP
¡Un servidor MCP para análisis de scRNA-Seq con lenguaje natural!
🪩¿Qué puede hacer?
- Módulo IO que lee y escribe datos scRNA-Seq con lenguaje natural
- Módulo de preprocesamiento, como filtrado, control de calidad, normalización, escalado, genes altamente variables, PCA, vecinos,...
- Módulo de herramientas, como agrupamiento, expresión diferencial, etc.
- Módulo de gráficos, como violín, mapa de calor y diagrama de puntos
- análisis de la comunicación célula-célula
❓¿Para quién es esto?
- ¡Cualquiera que quiera hacer análisis de scRNA-Seq en lenguaje natural!
- Desarrolladores de agentes que desean llamar a las funciones de scanpy para sus aplicaciones
🌐¿Dónde utilizarlo?
Puede usar scmcp en la mayoría de los clientes de IA, complementos o marcos de agentes que admiten MCP:
- Clientes de IA, como Cherry Studio
- Complementos, como Cline
- Marcos de agentes, como Agno
🎬 Demostración
Una demostración que muestra el análisis de grupos de células scRNA-Seq en un cliente de IA Cherry Studio utilizando lenguaje natural basado en scmcp
https://github.com/user-attachments/assets/93a8fcd8-aa38-4875-a147-a5eeff22a559
🏎️ Inicio rápido
Instalar
Instalar desde PyPI
Puedes probarlo ejecutando
ejecutar scnapy-server localmente
Consulte la siguiente configuración en su cliente MCP:
ejecutar scnapy-server de forma remota
Consulte la siguiente configuración en su cliente MCP:
Ejecútalo en tu servidor
Luego configura tu cliente MCP, de la siguiente manera:
🤝 Contribuyendo
Si tiene alguna pregunta, puede enviar un problema o contactarme ( hsh-me@outlook.com ). ¡También agradecemos sus contribuciones al código!
hybrid server
The server is able to function both locally and remotely, depending on the configuration or use case.
Un servidor MCP que permite el análisis de secuenciación de ARN de una sola célula a través del lenguaje natural, apoyando tareas de procesamiento, visualización y análisis de datos sin necesidad de conocimientos de codificación.
Related MCP Servers
- -securityAlicense-qualityAn MCP server that enables language models to fetch protein information from the UniProt database, including protein details, sequences, functions, and structures.Last updated -PythonMIT License
- AsecurityFlicenseAqualityAn MCP server that provides comprehensive Excel file operations, data analysis, and visualization capabilities for working with various spreadsheet formats like XLSX, CSV, and JSON.Last updated -836Python
- -securityAlicense-qualityAn MCP server that enables access to clinical evidence from the CIViC database, allowing users to search across variants, diseases, drugs, and phenotypes to support precision oncology research.Last updated -43PythonMIT License
- AsecurityAlicenseAqualityAn open-source MCP server that connects to various data sources (SQL databases, CSV, Parquet files), allowing AI models to execute SQL queries and generate data visualizations for analytics and business intelligence.Last updated -1035PythonMIT License