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Glama

SCMCP

¡Un servidor MCP para análisis de scRNA-Seq con lenguaje natural!

🪩¿Qué puede hacer?

  • Módulo IO que lee y escribe datos scRNA-Seq con lenguaje natural
  • Módulo de preprocesamiento, como filtrado, control de calidad, normalización, escalado, genes altamente variables, PCA, vecinos,...
  • Módulo de herramientas, como agrupamiento, expresión diferencial, etc.
  • Módulo de gráficos, como violín, mapa de calor y diagrama de puntos
  • análisis de la comunicación célula-célula

❓¿Para quién es esto?

  • ¡Cualquiera que quiera hacer análisis de scRNA-Seq en lenguaje natural!
  • Desarrolladores de agentes que desean llamar a las funciones de scanpy para sus aplicaciones

🌐¿Dónde utilizarlo?

Puede usar scmcp en la mayoría de los clientes de IA, complementos o marcos de agentes que admiten MCP:

  • Clientes de IA, como Cherry Studio
  • Complementos, como Cline
  • Marcos de agentes, como Agno

🎬 Demostración

Una demostración que muestra el análisis de grupos de células scRNA-Seq en un cliente de IA Cherry Studio utilizando lenguaje natural basado en scmcp

https://github.com/user-attachments/assets/93a8fcd8-aa38-4875-a147-a5eeff22a559

🏎️ Inicio rápido

Instalar

Instalar desde PyPI

pip install scmcp

Puedes probarlo ejecutando

scmcp run
ejecutar scnapy-server localmente

Consulte la siguiente configuración en su cliente MCP:

"mcpServers": { "scmcp": { "command": "scmcp", "args": [ "run" ] } }
ejecutar scnapy-server de forma remota

Consulte la siguiente configuración en su cliente MCP:

Ejecútalo en tu servidor

scmcp run --transport sse --port 8000

Luego configura tu cliente MCP, de la siguiente manera:

http://localhost:8000/sse

🤝 Contribuyendo

Si tiene alguna pregunta, puede enviar un problema o contactarme ( hsh-me@outlook.com ). ¡También agradecemos sus contribuciones al código!

Install Server
A
security – no known vulnerabilities
A
license - permissive license
A
quality - confirmed to work

hybrid server

The server is able to function both locally and remotely, depending on the configuration or use case.

Un servidor MCP que permite el análisis de secuenciación de ARN de una sola célula a través del lenguaje natural, apoyando tareas de procesamiento, visualización y análisis de datos sin necesidad de conocimientos de codificación.

  1. 🪩¿Qué puede hacer?
    1. ❓¿Para quién es esto?
      1. 🌐¿Dónde utilizarlo?
        1. 🎬 Demostración
          1. 🏎️ Inicio rápido
            1. Instalar
          2. 🤝 Contribuyendo

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