SCMCP

¡Un servidor MCP para análisis de scRNA-Seq con lenguaje natural!

🪩¿Qué puede hacer?

Módulo IO que lee y escribe datos scRNA-Seq con lenguaje natural
Módulo de preprocesamiento, como filtrado, control de calidad, normalización, escalado, genes altamente variables, PCA, vecinos,...
Módulo de herramientas, como agrupamiento, expresión diferencial, etc.
Módulo de gráficos, como violín, mapa de calor y diagrama de puntos
análisis de la comunicación célula-célula

¡Cualquiera que quiera hacer análisis de scRNA-Seq en lenguaje natural!
Desarrolladores de agentes que desean llamar a las funciones de scanpy para sus aplicaciones

Puede usar scmcp en la mayoría de los clientes de IA, complementos o marcos de agentes que admiten MCP:

Una demostración que muestra el análisis de grupos de células scRNA-Seq en un cliente de IA Cherry Studio utilizando lenguaje natural basado en scmcp

Instalar desde PyPI

pip install scmcp

Puedes probarlo ejecutando

scmcp run

Consulte la siguiente configuración en su cliente MCP:

"mcpServers": {
  "scmcp": {
    "command": "scmcp",
    "args": [
      "run"
    ]
  }
}

Consulte la siguiente configuración en su cliente MCP:

Ejecútalo en tu servidor

scmcp run --transport sse --port 8000

Luego configura tu cliente MCP, de la siguiente manera:

http://localhost:8000/sse

Si tiene alguna pregunta, puede enviar un problema o contactarme ( hsh-me@outlook.com ). ¡También agradecemos sus contribuciones al código!