plant-public-mcp

MCP публичных интерфейсов по биоинформатике растений: UniProt / NCBI / InterProScan / PDB / AlphaFold, а также Ensembl Plants, Sol Genomics (публичный вход для паслёновых), арабидопсис BAR / ATTED / STRING.

Данный пакет не содержит никаких локальных геномов, локальных RNA-seq или данных видовых специализированных баз. Все данные получаются через публичные API; инструменты без открытого API возвращают только шаги отправки и рекомендации по параметрам, не выдумывая результаты.

Охватываемые ресурсы

Паслёновые: используйте ensembl_plants_gene(species="solanum_lycopersicum", ...) или plant_resource_guide("solgenomics"). Этот пакет не включает специализированную базу перца.

Related MCP server: BioContextAI Knowledgebase MCP

Запуск

cd plant-public-mcp
uv sync
uv run server.py

Регистрация Cursor / Claude / MiniMax:

{
  "mcpServers": {
    "plant-public": {
      "command": "uv",
      "args": ["run", "--directory", "/absolute/path/to/plant-public-mcp", "server.py"]
    }
  }
}

CLI: uv run plant-cli uniprot summary P0DP23

Лицензия

MIT. Вышестоящие базы данных имеют свои собственные условия использования; при вызовах соблюдайте ограничения скорости и требования к указанию авторства.