plant-public-mcp

植物バイオインフォマティクス 公開インターフェース MCP：UniProt / NCBI / InterProScan / PDB / AlphaFold、および Ensembl Plants、Sol Genomics（ナス科の公開エントリーポイント）、シロイヌナズナ BAR / ATTED / STRING。

本パッケージには、ローカルゲノム、ローカルRNA-seq、種特異的データベースのデータは一切含まれません。データはすべて公開APIを経由します。オープンAPIのないツールは、提出手順とパラメータの提案のみを返し、結果を捏造しません。

対応リソース

ナス科：ensembl_plants_gene(species="solanum_lycopersicum", ...) または plant_resource_guide("solgenomics") を使用してください。本パッケージはトウガラシ専用データベースを含みません。

Related MCP server: BioContextAI Knowledgebase MCP

実行

cd plant-public-mcp
uv sync
uv run server.py

Cursor / Claude / MiniMax への登録：

{
  "mcpServers": {
    "plant-public": {
      "command": "uv",
      "args": ["run", "--directory", "/absolute/path/to/plant-public-mcp", "server.py"]
    }
  }
}

CLI：uv run plant-cli uniprot summary P0DP23

ライセンス

MIT。上流のデータベースにはそれぞれ独自の利用規約があります。呼び出し時はレート制限とクレジット表記の要件を遵守してください。