plant-public-mcp

Pflanzenbioinformatik-MCP für öffentliche Schnittstellen: UniProt / NCBI / InterProScan / PDB / AlphaFold, sowie Ensembl Plants, Sol Genomics (öffentlicher Einstieg für Nachtschattengewächse), Arabidopsis BAR / ATTED / STRING.

Dieses Paket enthält keine lokalen Genome, keine lokalen RNA-seq-Daten und keine artspezifischen Datenbanken. Die Daten stammen ausschließlich aus öffentlichen APIs. Werkzeuge ohne öffentliche API geben nur Einreichungsschritte und Parameterempfehlungen zurück, ohne Ergebnisse zu erfinden.

Abgedeckte Ressourcen

Nachtschattengewächse: Verwenden Sie ensembl_plants_gene(species="solanum_lycopersicum", ...) oder plant_resource_guide("solgenomics"). Dieses Paket enthält keine spezielle Chili-Datenbank.

Related MCP server: BioContextAI Knowledgebase MCP

Ausführung

cd plant-public-mcp
uv sync
uv run server.py

Cursor / Claude / MiniMax Registrierung:

{
  "mcpServers": {
    "plant-public": {
      "command": "uv",
      "args": ["run", "--directory", "/absolute/path/to/plant-public-mcp", "server.py"]
    }
  }
}

CLI: uv run plant-cli uniprot summary P0DP23

Lizenz

MIT. Die Upstream-Datenbanken haben jeweils ihre eigenen Nutzungsbedingungen; bitte beachten Sie Zugriffsratenbegrenzung und Anforderungen an die Quellenangabe.