plant-public-mcp

Interfaz Pública MCP de Bioinformática Vegetal: UniProt / NCBI / InterProScan / PDB / AlphaFold, así como Ensembl Plants, Sol Genomics (entrada pública de solanáceas), Arabidopsis BAR / ATTED / STRING.

Este paquete no incluye ningún genoma local, RNA-seq local ni datos de bases de datos específicas de especies. Todos los datos provienen de API públicas; las herramientas sin API abierta solo devuelven pasos de envío y sugerencias de parámetros, sin inventar resultados.

Recursos cubiertos

Solanáceas: use ensembl_plants_gene(species="solanum_lycopersicum", ...) o plant_resource_guide("solgenomics"). Este paquete no incluye bases de datos específicas de pimiento.

Related MCP server: BioContextAI Knowledgebase MCP

Ejecución

cd plant-public-mcp
uv sync
uv run server.py

Registro de Cursor / Claude / MiniMax:

{
  "mcpServers": {
    "plant-public": {
      "command": "uv",
      "args": ["run", "--directory", "/absolute/path/to/plant-public-mcp", "server.py"]
    }
  }
}

CLI: uv run plant-cli uniprot summary P0DP23

Licencia

MIT. Las bases de datos upstream tienen sus propios términos de uso; al llamarlas, respete los límites de velocidad y los requisitos de atribución.