⚠️ Важное уведомление : этот репозиторий больше не поддерживается. Пожалуйста, посетите SCMCPHub для получения последней версии серверов MCP.

СКМКП

MCP-сервер для анализа scRNA-Seq с использованием естественного языка!

🪩 Что он может делать?

• Модуль ввода-вывода, например, чтение и запись данных scRNA-Seq на естественном языке

• Модуль предварительной обработки, такой как фильтрация, контроль качества, нормализация, масштабирование, высоковариабельные гены, PCA, соседи,...

• Модуль инструментов, такой как кластеризация, дифференциальное выражение и т. д.

• Модуль построения графиков, например, скрипка, тепловая карта, точечный график

• анализ межклеточной коммуникации

Related MCP server: SCMCP

❓ Для кого это?

• Всем, кто хочет провести анализ scRNA-Seq на естественном языке!

• Разработчики агентов, которые хотят вызывать функции scanpy для своих приложений

🌐 Где это использовать?

Вы можете использовать scmcp в большинстве клиентов ИИ, плагинов или фреймворков агентов, которые поддерживают MCP:

• Клиенты ИИ, такие как Cherry Studio

• Плагины, такие как Cline

• Агентские фреймворки, такие как Agno

🎬 Демо

Демонстрация, демонстрирующая анализ кластеров клеток scRNA-Seq в клиенте ИИ Cherry Studio с использованием естественного языка на основе scmcp

https://github.com/user-attachments/assets/93a8fcd8-aa38-4875-a147-a5eeff22a559

🏎️ Быстрый старт

Установить

Установить из PyPI

pip install scmcp

Вы можете проверить это, запустив

scmcp run

запустить scnapy-server локально

Ознакомьтесь со следующей конфигурацией в вашем клиенте MCP:

"mcpServers": {
  "scmcp": {
    "command": "scmcp",
    "args": [
      "run"
    ]
  }
}

запустить scnapy-server удаленно

Ознакомьтесь со следующей конфигурацией в вашем клиенте MCP:

запустите его на своем сервере

scmcp run --transport sse --port 8000

Затем настройте свой MCP-клиент следующим образом:

http://localhost:8000/sse

🤝 Вклад

Если у вас есть вопросы, добро пожаловать, чтобы отправить сообщение об ошибке или связаться со мной ( hsh-me@outlook.com ). Вклад в код также приветствуется!