SCMCP

¡Un servidor MCP para análisis de scRNA-Seq con lenguaje natural!

🪩¿Qué puede hacer?

• Módulo IO que lee y escribe datos scRNA-Seq con lenguaje natural

• Módulo de preprocesamiento, como filtrado, control de calidad, normalización, escalado, genes altamente variables, PCA, vecinos,...

• Módulo de herramientas, como agrupamiento, expresión diferencial, etc.

• Módulo de gráficos, como violín, mapa de calor y diagrama de puntos

• análisis de la comunicación célula-célula

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❓¿Para quién es esto?

• ¡Cualquiera que quiera hacer análisis de scRNA-Seq en lenguaje natural!

• Desarrolladores de agentes que desean llamar a las funciones de scanpy para sus aplicaciones

🌐¿Dónde utilizarlo?

Puede usar scmcp en la mayoría de los clientes de IA, complementos o marcos de agentes que admiten MCP:

• Clientes de IA, como Cherry Studio

• Complementos, como Cline

• Marcos de agentes, como Agno

🎬 Demostración

Una demostración que muestra el análisis de grupos de células scRNA-Seq en un cliente de IA Cherry Studio utilizando lenguaje natural basado en scmcp

https://github.com/user-attachments/assets/93a8fcd8-aa38-4875-a147-a5eeff22a559

🏎️ Inicio rápido

Instalar

Instalar desde PyPI

pip install scmcp

Puedes probarlo ejecutando

scmcp run

ejecutar scnapy-server localmente

Consulte la siguiente configuración en su cliente MCP:

"mcpServers": {
  "scmcp": {
    "command": "scmcp",
    "args": [
      "run"
    ]
  }
}

ejecutar scnapy-server de forma remota

Consulte la siguiente configuración en su cliente MCP:

Ejecútalo en tu servidor

scmcp run --transport sse --port 8000

Luego configura tu cliente MCP, de la siguiente manera:

http://localhost:8000/sse

🤝 Contribuyendo

Si tiene alguna pregunta, puede enviar un problema o contactarme ( hsh-me@outlook.com ). ¡También agradecemos sus contribuciones al código!