propaths-mcp

ProPaths 검증 단백질 상호작용체(interactome)를 AI 에이전트용 읽기 전용 도구로 노출하는 MCP 서버입니다. 공개 ProPaths API(https://propaths.net) 위의 얇은 클라이언트이므로 모든 도구는 API의 JSON을 그대로 반환합니다. 계정도, API 키도 필요 없습니다.

ProPaths는 단백질의 1차 문헌을 읽고 유형화되고 방향성이 있는 메커니즘적 상호작용의 검증된 그래프와 경로 온톨로지를 반환합니다. 현재 한 단백질(ATXN3)이 완전히 매핑되어 있습니다.

빠른 시작 (Claude Desktop / 모든 MCP 클라이언트)

이 내용을 MCP 클라이언트 설정에 추가하세요. uvx가 서버를 가져와 실행합니다. 클론하거나 설치할 것이 없습니다.

{
  "mcpServers": {
    "propaths": {
      "command": "uvx",
      "args": ["propaths-mcp"]
    }
  }
}

그런 다음, 예를 들어 *"ProPaths에서 SCA3를 검색하고 가장 강력한 메커니즘적 상호작용을 요약해 줘"*라고 요청하세요. 에이전트는 search_proteins를 호출한 다음 get_protein을 호출하고, get_interaction으로 더 자세히 파고들 것입니다.

원시 API를 선호하시나요? 공개되어 있고 키가 필요 없습니다:

curl https://propaths.net/api/protein/ATXN3
curl 'https://propaths.net/api/search?q=SCA3'

도구

또한 MCP 리소스(propaths://schema, propaths://interaction-types, propaths://pathways/tree, propaths://protein/{symbol} 템플릿) 및 프롬프트(profile-protein, strongest-evidence, explain-pathway)로도 노출됩니다.

모든 도구는 읽기 전용이며 멱등적입니다.

구성

uvx 없이 실행

pip install propaths-mcp
propaths-mcp            # runs the stdio server
# or: python -m propaths_mcp

게시되기 전에는 저장소에서 직접 실행할 수 있습니다:

uvx --from git+https://github.com/Tahsin-Kazi/propaths-mcp propaths-mcp

참고 사항

• 읽기 전용이며 공개적입니다. 읽기는 클라이언트당 속도 제한이 있습니다. 쓰기/강화 액세스 및 호스팅된 MCP는 게이트가 있습니다. 연락 주세요.

• 오류는 우아하게 처리됩니다: 존재하지 않는 단백질은 {"error": "...", "status": 404}를 반환하고, API에 연결할 수 없으면 힌트와 함께 예외가 발생합니다.

문서: https://propaths.net/quick-start · 라이선스: MIT