propaths-mcp

MCPサーバーで、ProPathsの検証済みタンパク質相互作用ネットワークをAIエージェント向けの読み取り専用ツールとして公開します。これは公開ProPaths API（https://propaths.net）のシンクライアントであり、すべてのツールはAPIのJSONをそのまま返します。アカウントもAPIキーも不要です。

ProPathsはタンパク質の一次文献を読み取り、型付き・有向・機構的な相互作用の検証済みグラフとパスウェイオントロジーを返します。現在、1つのタンパク質（ATXN3）が完全にマッピングされています。

クイックスタート（Claude Desktop / 任意のMCPクライアント）

これをMCPクライアント設定に追加します。uvxがサーバーを取得して実行します。クローンやインストールは不要です。

{
  "mcpServers": {
    "propaths": {
      "command": "uvx",
      "args": ["propaths-mcp"]
    }
  }
}

次に、例えば*「ProPathsでSCA3を検索し、その最も強い機構的相互作用を要約してください」*と尋ねます。エージェントはsearch_proteinsを呼び出し、次にget_proteinを呼び出し、get_interactionで詳細を調べます。

生のAPIを好みますか？公開されており、キーは不要です：

curl https://propaths.net/api/protein/ATXN3
curl 'https://propaths.net/api/search?q=SCA3'

ツール

また、MCP リソース（propaths://schema、propaths://interaction-types、propaths://pathways/tree、およびpropaths://protein/{symbol}テンプレート）とプロンプト（profile-protein、strongest-evidence、explain-pathway）としても公開されています。

すべてのツールは読み取り専用で冪等です。

設定

uvxなしで実行

pip install propaths-mcp
propaths-mcp            # runs the stdio server
# or: python -m propaths_mcp

公開前は、リポジトリから直接実行できます：

uvx --from git+https://github.com/Tahsin-Kazi/propaths-mcp propaths-mcp

注記

• 読み取り専用で公開されています。読み取りはクライアントごとにレート制限されます。書き込み/エンリッチメントアクセスとホスト型MCPは制限されています。お問い合わせください。

• エラーは優雅に処理されます：存在しないタンパク質は{"error": "...", "status": 404}を返し、APIに到達できない場合はヒント付きで例外を発生させます。

ドキュメント：https://propaths.net/quick-start · ライセンス：MIT