rdkit-tools-mcp
Сервер RDKit Tools MCP
Сервер Model Context Protocol (MCP), предоставляющий основные хемоинформатические операции RDKit в качестве инструментов для использования AI-агентами (например, наборами инструментов DIAL).
Дополняет другие химические MCP (визуализация SMILES, доступ к базе данных ChEMBL), охватывая внутрипроцессные хемоинформатические операции, которые они не предоставляют: вычисление дескрипторов/отпечатков, поиск по сходству и подструктурам, перечисление реакций, стандартизация и генерация 3D-конформеров.
Инструменты
Инструмент | Описание |
| Разобрать строку SMILES, вернуть ее каноническую форму и базовую информацию об идентичности |
| Очистить молекулу: удалить соли/растворители, оставить наибольший фрагмент, нейтрализовать заряды |
| Вычислить дескрипторы (MolWt, LogP, TPSA, HBD/HBA, количество колец, QED, ...) для одного SMILES |
| То же самое для пакета SMILES |
| Вычислить отпечаток ( |
| Сходство Танимото между двумя молекулами |
| Ранжировать кандидатов SMILES по сходству с запрашиваемой молекулой |
| Проверить, какие кандидаты соответствуют паттерну подструктуры SMARTS |
| Применить шаблон реакции SMARTS/SMIRKS к реагентам, вернуть уникальные продукты |
| Сгенерировать (опционально оптимизированные силовым полем) 3D-конформеры в виде MOL-блоков |
"Running locally" header → "Запуск локально"
"Last paragraph": "Сервер использует MCP через HTTP Streamable транспорт по адресу /mcp."
Actually, better: "Сервер говорит на MCP по HTTP Streamable транспорту по адресу /mcp." Hmm, that's too literal. "Сервер работает через MCP по HTTP Streamable транспорту и доступен по адресу /mcp."
Or more natural: "Сервер использует протокол MCP через HTTP Streamable транспорт по адресу /mcp."
I think a clean translation: "Сервер общается по MCP через HTTP Streamable транспорт по адресу /mcp."
Let me go with: "Сервер использует транспорт HTTP Streamable для MCP и доступен по адресу /mcp."
Actually, simpler: "Сервер работает через MCP по HTTP Streamable транспорту на /mcp."
Let me finalize the full translation. Also "GXP1" and "GXP2" look like they might be placeholders for content. Since instructions say preserve them verbatim, I'll keep them as standalone lines.
This server cannot be installed
Maintenance
Resources
Unclaimed servers have limited discoverability.
Looking for Admin?
If you are the server author, to access and configure the admin panel.
Related MCP Connectors
Machine-readable utilities and datasets for AI agents.
CVE lookups (NVD) and dependency-manifest audits (OSV) for AI agents. No API keys.
CVE lookups (NVD) and dependency-manifest audits (OSV) for AI agents. No API keys.
Latest Blog Posts
- Who's Calling? MCP Hosts Are an Identity Blind Spot (And the Spec Knows It)By Om-Shree-0709 on .mcpAgent IdentityOAuth 2.1
- Your AI Chatbot Just Exposed Your CEO's Salary to an InternBy Om-Shree-0709 on .Agent IdentityMCP SecurityOAuth Delegation
- Why MCP Servers Need Execution Sandboxing (And Why Your Current Stack Isn't Enough)By Om-Shree-0709 on .Agentic AiPrompt InjectionWebAssembly
MCP directory API
We provide all the information about MCP servers via our MCP API.
curl -X GET 'https://glama.ai/api/mcp/v1/servers/mtx-auto/rdkit-tools-mcp'
If you have feedback or need assistance with the MCP directory API, please join our Discord server