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# Endpoint: https://rdfportal.org/primary/sparql # Description: RDFized reference gene expresson dataset derived from CAGE and GeneChip experiments in the RefEx database. PREFIX refexo: <http://purl.jp/bio/01/refexo#> PREFIX dct: <http://purl.org/dc/terms/> PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> SELECT ?refex_id ?ex_value ?see_also ?RefExSample ?sample_id ?taxonomy ?age ?stage ?description ?cell_type ?disease ?dev_site ?refexo_sample FROM <http://refex.dbcls.jp/rdf/fantom5> FROM <http://refex.dbcls.jp/rdf/genechip> FROM <http://purl.jp/bio/01/refexo> WHERE { ?RefExEntry a refexo:RefExEntry ; dct:identifier ?refex_id ; refexo:expValue ?ex_value ; rdfs:seeAlso ?see_also ; refexo:refexSample ?RefExSample . ?RefExSample a refexo:RefExSample ; dct:identifier ?sample_id . OPTIONAL { ?RefExSample refexo:organism ?taxonomy . } OPTIONAL { ?RefExSample refexo:age ?age . } OPTIONAL { ?RefExSample refexo:developmentalStage ?stage . } OPTIONAL { ?RefExSample refexo:refexRefinedDescription ?description . } OPTIONAL { ?RefExSample refexo:sampleReference / refexo:belongsToCellType ?cell_type . } OPTIONAL { ?RefExSample refexo:sampleReference / refexo:belongsToDisease ?disease . } OPTIONAL { ?RefExSample refexo:sampleReference / refexo:belongsToDevelopmentSite ?dev_site . } OPTIONAL { ?RefExSample refexo:sampleReference / refexo:sample ?refexo_sample . } } LIMIT 100