🔍 使 AI 助手能够通过简单的 MCP 界面搜索和访问 bioRxiv 论文。
bioRxiv MCP 服务器通过模型上下文协议 (MCP) 在 AI 助手和 bioRxiv 预印本库之间架起了一座桥梁。它允许 AI 模型以编程方式搜索生物学预印本并访问其元数据。
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Related MCP server: paper-fetch-mcp
Python 3.10+
FastMCP 库
克隆存储库：
git clone https://github.com/JackKuo666/bioRxiv-MCP-Server.git
cd bioRxiv-MCP-Server安装所需的依赖项：
pip install -r requirements.txt要通过Smithery自动为 Claude Desktop 安装 bioRxiv 服务器：
npx -y @smithery/cli@latest install @JackKuo666/biorxiv-mcp-server --client claude --config "{}"将以下内容粘贴到设置 → 光标设置 → MCP → 添加新服务器：
Mac/Linux
npx -y @smithery/cli@latest run @JackKuo666/biorxiv-mcp-server --client cursor --config "{}" npx -y @smithery/cli@latest install @JackKuo666/biorxiv-mcp-server --client windsurf --config "{}"npx -y @smithery/cli@latest install @JackKuo666/biorxiv-mcp-server --client cline --config "{}"将此配置添加到您的claude_desktop_config.json ：
（Mac 操作系统）
{
"mcpServers": {
"biorxiv": {
"command": "python",
"args": ["-m", "biorxiv-mcp-server"]
}
}
}（Windows 版本）：
{
"mcpServers": {
"biorxiv": {
"command": "C:\\Users\\YOUR_USERNAME\\AppData\\Local\\Programs\\Python\\Python311\\python.exe",
"args": [
"-m",
"biorxiv-mcp-server"
]
}
}
}与 Cline 一起使用
{
"mcpServers": {
"biorxiv": {
"command": "bash",
"args": [
"-c",
"source /home/YOUR/PATH/mcp-server-bioRxiv/.venv/bin/activate && python /home/YOUR/PATH/mcp-server-bioRxiv/biorxiv_server.py"
],
"env": {},
"disabled": false,
"autoApprove": []
}
}
}启动 MCP 服务器：
python biorxiv_server.pybioRxiv MCP 服务器提供以下工具：
search_biorxiv_key_words ：使用关键词搜索 bioRxiv 上的文章。
search_biorxiv_advanced ：使用多个参数对 bioRxiv 上的文章执行高级搜索。
get_biorxiv_metadata ：使用 DOI 获取 bioRxiv 文章的元数据。
您可以要求 AI 助手使用以下查询来搜索论文：
Can you search bioRxiv for recent papers about genomics?获得 DOI 后，您可以询问更多详细信息：
Can you show me the metadata for the paper with DOI 10.1101/123456?biorxiv_server.py ：使用 FastMCP 的主要 MCP 服务器实现
biorxiv_web_search.py ：包含用于搜索 bioRxiv 的网络抓取逻辑
Python 3.10+
FastMCP
异步
日志记录
欢迎贡献代码！欢迎提交 Pull 请求。
该项目已获得 MIT 许可。
此工具仅供研究之用。请遵守 bioRxiv 的服务条款并负责任地使用此工具。
This server cannot be installed
Unclaimed servers have limited discoverability.
If you are the server author, to access and configure the admin panel.
A comprehensive Model Context Protocol (MCP) server that enables AI assistants to interact with yo…
Auditable MCP server for PubMed, Europe PMC, ClinicalTrials.gov, and bioRxiv/medRxiv queries
AI-powered bioprotocol optimization — generate, search, and manage lab protocols via MCP
We provide all the information about MCP servers via our MCP API.
curl -X GET 'https://glama.ai/api/mcp/v1/servers/JackKuo666/bioRxiv-MCP-Server'
If you have feedback or need assistance with the MCP directory API, please join our Discord server