mcp-simple-pubmed

MCP Simple PubMed

Ein MCP-Server, der über die Entrez-API Zugriff auf PubMed-Artikel bietet.

Merkmale

Durchsuchen Sie die PubMed-Datenbank mithilfe von Schlüsselwörtern
Zugriff auf Artikelzusammenfassungen
Vollständigen Text herunterladen, wenn verfügbar (für Open-Access-Artikel, die direkt auf PubMed verfügbar sind)

Bitte beachten Sie, dass das Tool eine XML-Version des Volltextes zurückgibt. Diese ist jedoch für KIs nützlicher als ein „menschenlesbarer“ Text, da sie zusätzliche Informationen zur Dokumentstruktur liefert. Zumindest bevorzugt Claude 3.5 Sonnet diese Option.

Bitte beachten Sie auch, dass die Unfähigkeit dieses Tools und möglicherweise anderer Tools, den Volltext einer Arbeit zu liefern, nicht unbedingt auf deren Nichtverfügbarkeit zurückzuführen sein muss. Beim Testen dieses Tools stieß ich auf eine Arbeit, deren Volltext auf PubMed fehlte. Als Claude die Publikations-URL (die wir über DOI erhalten hatten) per Fetch zugriff, erhielt er die Fehlermeldung „Verboten“. Ich konnte jedoch mit einem normalen Browser auf dieselbe Seite zugreifen.

Mit anderen Worten: Wenn Ihr KI-Assistent mit diesem Tool nicht in der Lage ist, den vollständigen Text eines Dokuments abzurufen, lohnt es sich, es manuell mit einem normalen Webbrowser zu versuchen.

Dieses Tool bietet Ihnen natürlich keinen Zugriff auf kostenpflichtige Artikel. Sie können diese möglicherweise über Ihren Bibliothekszugang oder – als letzte Möglichkeit – über eine bestimmte Website lesen, die öffentlich finanzierte Forschung kostenlos zugänglich macht.

Installation

Installation über Smithery

So installieren Sie Simple PubMed für Claude Desktop automatisch über Smithery :

npx -y @smithery/cli install mcp-simple-pubmed --client claude

Manuelle Installation

pip install mcp-simple-pubmed

Konfiguration

Der Server benötigt die folgenden Umgebungsvariablen:

PUBMED_EMAIL : Ihre E-Mail-Adresse (erforderlich für NCBI)
PUBMED_API_KEY : Optionaler API-Schlüssel für höhere Ratenlimits

Die Standard-Ratenbegrenzung beträgt 3 Anfragen pro Sekunde. Es wurde keine Ratenbegrenzung implementiert, da es im typischen Anwendungsszenario sehr unwahrscheinlich ist, dass Ihre KI mehr Verkehr erzeugt. Bei Bedarf können Sie einen API-Schlüssel registrieren , der Ihnen 10 Anfragen pro Sekunde ermöglicht. Weitere Informationen hierzu finden Sie auf den NCBI-Seiten .

Verwendung mit Claude Desktop

Fügen Sie Ihrer Claude Desktop-Konfiguration ( claude_desktop_config.json ) Folgendes hinzu:

(Mac OS)

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "python",
      "args": ["-m", "mcp_simple_pubmed"],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

(Windows)

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "C:\\Users\\YOUR_USERNAME\\AppData\\Local\\Programs\\Python\\Python311\\python.exe",
      "args": [
        "-m",
        "mcp_simple_pubmed"
      ],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

Lizenz

MIT-Lizenz

mcp-simple-pubmed

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