remote-capable server

The server can be hosted and run remotely because it primarily relies on remote services or has no dependency on the local environment.

Integrations

Enables retrieval of publication URLs through DOI (Digital Object Identifier) to access articles that may not be directly available through PubMed
Supports downloading full text for open access articles available directly on PubMed
Provides access to PubMed articles through the Entrez API, allowing users to search the PubMed database, access article abstracts, and download full text for open access articles

MCP 简易 PubMed

通过 Entrez API 提供对 PubMed 文章的访问的 MCP 服务器。

特征

使用关键词搜索 PubMed 数据库
访问文章摘要
下载全文（适用于 PubMed 上直接提供的开放获取文章）

请注意，该工具返回的是 XML 格式的全文。然而，它对人工智能来说比“人类可读”的文本更有用，因为它能为人工智能提供关于文档结构的额外信息。至少，Claude 3.5 Sonnet 表示他更喜欢这种格式。

另请注意，此工具以及其他工具无法提供论文全文可能并非由于其不可用。在测试此工具时，我遇到了一篇在 PubMed 上没有全文的论文，当 Claude 使用 fetch 访问出版物 URL（我们通过 DOI 获取）时，他收到了“禁止访问”错误。然而，我可以使用常规浏览器访问同一个页面。

换句话说，如果您的 AI 助手无法使用此工具获取论文全文，则值得使用常规网络浏览器手动尝试。

最后，此工具当然无法让您访问付费墙/付费论文。您可以通过图书馆访问权限阅读这些论文，或者——作为最后的手段——通过某个致力于免费提供公共资助研究的网站阅读。

安装

通过 Smithery 安装

要通过Smithery自动为 Claude Desktop 安装 Simple PubMed：

npx -y @smithery/cli install mcp-simple-pubmed --client claude

手动安装

pip install mcp-simple-pubmed

配置

服务器需要以下环境变量：

PUBMED_EMAIL ：您的电子邮件地址（NCBI 要求）
PUBMED_API_KEY ：用于更高速率限制的可选 API 密钥

标准速率限制为每秒 3 个请求。由于在典型使用场景下，您的 AI 不太可能产生更多流量，因此未实施速率限制。如果您需要，可以注册一个 API 密钥，该密钥将为您提供每秒 10 个请求的速率。请参阅NCBI 页面了解更多信息。

与 Claude Desktop 一起使用

添加到您的 Claude Desktop 配置（ claude_desktop_config.json ）：

（Mac 操作系统）

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "python",
      "args": ["-m", "mcp_simple_pubmed"],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

（视窗）

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "C:\\Users\\YOUR_USERNAME\\AppData\\Local\\Programs\\Python\\Python311\\python.exe",
      "args": [
        "-m",
        "mcp_simple_pubmed"
      ],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

执照

MIT 许可证

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license - permissive license

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quality - confirmed to work

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