PubMed-MCP-Server

PubMed MCP 服务器

🔍 让 AI 助手能够通过简单的 MCP 界面搜索、访问和分析 PubMed 文章。

PubMed MCP 服务器通过模型上下文协议 (MCP) 在 AI 助手和 PubMed 庞大的生物医学文献库之间架起了一座桥梁。它允许 AI 模型以编程方式搜索科学文章、访问其元数据并进行深度分析。

🤝 贡献 • 📝 报告错误

✨ 核心功能

• 🔎 论文搜索：使用关键字或高级搜索查询 PubMed 文章✅
• 🚀 高效检索：快速访问纸质元数据✅
• 📊 元数据访问：检索特定论文的详细元数据✅
• 📊 研究支持：促进生物医学科学研究和分析✅
• 📄 论文访问：尝试下载全文 PDF 内容✅
• 🧠 深度分析：对论文进行全面分析✅
• 📝 研究提示：一组专门用于论文分析的提示✅

🚀 快速入门

先决条件

• Python 3.10+
• FastMCP 库

安装

通过 Smithery 安装

要通过Smithery自动为 Claude Desktop 安装 pubmed-mcp-server：

克劳德

光标

将以下内容粘贴到设置 → 光标设置 → MCP → 添加新服务器：

• Mac/Linux

风帆冲浪

克莱恩

1. 克隆存储库：
   git clone https://github.com/JackKuo666/PubMed-MCP-Server.git cd PubMed-MCP-Server
2. 安装所需的依赖项：
   pip install -r requirements.txt

📊 使用方法

启动 MCP 服务器：

与 Claude Desktop 一起使用

将此配置添加到您的claude_desktop_config.json ：

（Mac 操作系统）

（Windows 版本）：

与 Cline 一起使用

🛠 MCP 工具

PubMed MCP 服务器提供以下工具：

1. search_pubmed_key_words ：使用关键词在 PubMed 上搜索文章。
2. search_pubmed_advanced ：使用多个参数对 PubMed 上的文章执行高级搜索。
3. get_pubmed_article_metadata ：使用 PMID 获取 PubMed 文章的元数据。
4. download_pubmed_pdf ：尝试下载 PubMed 文章的全文 PDF。
5. deep_paper_analysis ：对 PubMed 文章进行全面分析。

搜索论文

您可以要求 AI 助手使用以下查询来搜索论文：

获取论文详细信息

获得 PMID 后，您可以询问更多详细信息：

分析论文

您可以请求对论文进行深入分析：

📁 项目结构

• pubmed_server.py ：使用 FastMCP 的主要 MCP 服务器实现
• pubmed_web_search.py ：包含搜索 PubMed 和检索文章信息的逻辑

🔧 依赖项

• Python 3.10+
• FastMCP
• 异步
• 日志记录
• 请求
• beautifulsoup4

🤝 贡献

欢迎贡献代码！欢迎提交 Pull 请求。

📄 许可证

该项目已获得 MIT 许可。

⚠️ 免责声明

此工具仅供研究之用。请遵守 PubMed 的服务条款并负责任地使用此工具。