A
security-
licenseA
qualityAn MCP server that provides access to PubMed articles through the Entrez API.
Last updated -
134
MIT License
Сервер MCP PubMed
🔍 Предоставьте помощникам на основе искусственного интеллекта возможность искать, получать доступ и анализировать статьи PubMed с помощью простого интерфейса MCP.
Сервер PubMed MCP обеспечивает мост между помощниками ИИ и обширным хранилищем биомедицинской литературы PubMed через протокол контекста модели (MCP). Он позволяет моделям ИИ искать научные статьи, получать доступ к их метаданным и выполнять глубокий анализ программным способом.
🤝 Внести свой вклад • 📝 Сообщить об ошибке
✨ Основные характеристики
🔎 Поиск статей: поиск статей PubMed по ключевым словам или расширенный поиск ✅
🚀 Эффективный поиск: быстрый доступ к метаданным на бумаге ✅
📊 Доступ к метаданным: получение подробных метаданных для определенных статей ✅
📊 Поддержка исследований: содействие исследованиям и анализу в области биомедицинских наук ✅
📄 Доступ к бумажным документам: попытка загрузить полный текст PDF-контента ✅
🧠 Глубокий анализ: выполните комплексный анализ документов ✅
📝 Подсказки для исследования: набор специализированных подсказок для анализа статей ✅
🚀 Быстрый старт
Предпосылки
Питон 3.10+
Библиотека FastMCP
Установка
Установка через Smithery
Чтобы автоматически установить pubmed-mcp-server для Claude Desktop через Smithery :
Клод
npx -y @smithery/cli install @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client claude
Курсор
Вставьте следующее в Настройки → Настройки курсора → MCP → Добавить новый сервер:
Мак/Линукс
npx -y @smithery/cli@latest run @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client cursor --config "{}"
Виндсерфинг
npx -y @smithery/cli@latest install @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client windsurf --config "{}"
CЛиния
npx -y @smithery/cli@latest install @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client cline --config "{}"
Клонируйте репозиторий:
git clone https://github.com/JackKuo666/PubMed-MCP-Server.git cd PubMed-MCP-ServerУстановите необходимые зависимости:
pip install -r requirements.txt
📊 Использование
Запустите MCP-сервер:
python pubmed_server.py
Использование с Claude Desktop
Добавьте эту конфигурацию в ваш claude_desktop_config.json :
(Mac OS)
{
"mcpServers": {
"pubmed": {
"command": "python",
"args": ["-m", "pubmed-mcp-server"]
}
}
}
(Версия для Windows):
{
"mcpServers": {
"pubmed": {
"command": "C:\\Users\\YOUR\\PATH\\miniconda3\\envs\\mcp_server\\python.exe",
"args": [
"D:\\code\\YOUR\\PATH\\PubMed-MCP-Server\\pubmed_server.py"
],
"env": {},
"disabled": false,
"autoApprove": []
}
}
}
Использование с Клайном
{
"mcpServers": {
"pubmed": {
"command": "bash",
"args": [
"-c",
"source /home/YOUR/PATH/mcp-server-pubmed/.venv/bin/activate && python /home/YOUR/PATH/pubmed-mcp-server.py"
],
"env": {},
"disabled": false,
"autoApprove": []
}
}
}
🛠 Инструменты MCP
Сервер PubMed MCP предоставляет следующие инструменты:
search_pubmed_key_words: Поиск статей на PubMed по ключевым словам.search_pubmed_advanced: Выполнить расширенный поиск статей в PubMed по нескольким параметрам.get_pubmed_article_metadata: извлечение метаданных для статьи PubMed с использованием ее PMID.download_pubmed_pdf: попытка загрузить полный текст статьи PubMed в формате PDF.deep_paper_analysis: выполнить комплексный анализ статьи PubMed.
Поиск статей
Вы можете попросить ИИ-помощника поискать документы, используя такие запросы:
Can you search PubMed for recent papers about CRISPR?
Получение бумажных данных
Получив PMID, вы можете запросить более подробную информацию:
Can you show me the metadata for the paper with PMID 12345678?
Анализ документов
Вы можете запросить глубокий анализ статьи:
Can you perform a deep analysis of the paper with PMID 12345678?
📁 Структура проекта
pubmed_server.py: Основная реализация сервера MCP с использованием FastMCPpubmed_web_search.py: Содержит логику поиска PubMed и получения информации о статьях.
🔧 Зависимости
Питон 3.10+
FastMCP
асинк
ведение журнала
запросы
beautifulsoup4
🤝 Вклад
Вклады приветствуются! Пожалуйста, не стесняйтесь отправлять запрос на включение.
📄 Лицензия
Данный проект лицензирован по лицензии MIT.
⚠️ Отказ от ответственности
Этот инструмент предназначен только для исследовательских целей. Пожалуйста, уважайте условия обслуживания PubMed и используйте этот инструмент ответственно.
This server cannot be installed
hybrid server
The server is able to function both locally and remotely, depending on the configuration or use case.
🔍 Предоставьте помощникам на основе искусственного интеллекта возможность искать, получать доступ и анализировать статьи PubMed с помощью простого интерфейса MCP.
Related MCP Servers
- -security-license-qualityAn MCP server implementation that enables searching and retrieving research articles from PubMed with specific focus on open access content filtering and full-text link retrieval.Last updated -83
- -security-license-quality🔍 Enable AI assistants to search and access bioRxiv papers through a simple MCP interface. The bioRxiv MCP Server provides a bridge between AI assistants and bioRxiv's preprint repository through the Model Context Protocol (MCP). It allows AI models to search for biology preprints and access theirLast updated -20
- -security-license-quality🔍 Enable AI assistants to search and access medRxiv papers through a simple MCP interface. The medRxiv MCP Server provides a bridge between AI assistants and medRxiv's preprint repository through the Model Context Protocol (MCP). It allows AI models to search for health sciences preprints and acceLast updated -6