AACT临床试验MCP服务器

概述

模型上下文协议 (MCP) 服务器实现，使用 FastMCP 框架提供对 AACT（ClinicalTrials.gov 汇总分析）数据库的访问。该服务器允许 AI 助手直接从 ClinicalTrials.gov 数据库查询临床试验数据。

Related MCP server: BioMCP

特征

工具

• list_tables

  • 获取 AACT 数据库中所有可用表的概览

  • 有助于在分析之前了解数据库结构

• describe_table

  • 检查特定 AACT 表的详细结构

  • 显示列名和数据类型

  • 例如： {"table_name": "studies"}

• read_query

  • 在 AACT 临床试验数据库上执行 SELECT 查询

  • 通过验证安全地处理 SQL 查询

  • 例如： {"query": "SELECT nct_id, brief_title FROM ctgov.studies LIMIT 5"}

• append_insight

  • 记录分析过程中发现的关键发现和见解

  • 帮助构建分析性叙述

  • 示例： {"finding": "Phase 3 oncology trials have increased by 15% over the last 5 years"}

资源

• schema://database

  • 将数据库架构作为 JSON 资源返回

• memo://insights

  • 返回会话期间收集的见解的格式化备忘录

配置

必需的环境变量

• DB_USER ：您的 AACT 数据库用户名

• DB_PASSWORD ：您的 AACT 数据库密码

与语义内核一起使用

from semantic_kernel import Kernel
from semantic_kernel.connectors.mcp import MCPStdioPlugin

# Create an AACT Clinical Trials MCP plugin
aact_mcp = MCPStdioPlugin(
    name="aact",
    description="Clinical Trials Database Plugin",
    command="uvx",
    args=["mcp-server-aact"],
    env={
        "DB_USER": "your_aact_username", 
        "DB_PASSWORD": "your_aact_password"
    }
)

# Add to Semantic Kernel
kernel = Kernel()
kernel.add_plugin(aact_mcp)

示例提示

以下是一些与该插件一起使用的示例提示：

1. “乳腺癌临床试验中最常见的干预类型有哪些？”

2. “2023年完成了多少项3期临床试验？”

3. “向我展示不同国家糖尿病试验的入组统计数据”

4. “过去 5 年内有多少比例的肿瘤学试验报告了结果？”

实现细节

该服务器使用以下方式构建：

• FastMCP 用于模型上下文协议实现

• 用于 PostgreSQL 数据库连接的 Python psycopg2

• AACT 数据库作为 ClinicalTrials.gov 信息的数据源

执照

MIT 许可证

贡献

欢迎投稿！请：

• 在 GitHub 上打开一个问题

• 开始讨论

• 电子邮件: jonas.walheim@navis-bio.com

致谢

该项目的灵感来自以下代码，并最初基于以下代码：

• SQLite MCP 服务器

• DuckDB MCP 服务器

• 开放数据MCP

感谢这些出色的项目为我们指明了方向！🙌