bioRxiv MCP サーバー

🔍 AI アシスタントがシンプルな MCP インターフェースを通じて bioRxiv 論文を検索しアクセスできるようにします。

bioRxiv MCPサーバーは、モデルコンテキストプロトコル（MCP）を介してAIアシスタントとbioRxivのプレプリントリポジトリ間の橋渡しを提供します。これにより、AIモデルはプログラム的に生物学プレプリントを検索し、そのメタデータにアクセスできるようになります。

🤝 貢献する • 📝 バグを報告する

✨ コア機能

• 🔎 論文検索: キーワードまたは詳細検索でbioRxiv論文を検索 ✅

• 🚀 効率的な検索: 論文のメタデータへの高速アクセス ✅

• 📊 メタデータアクセス: 特定の論文の詳細なメタデータを取得します ✅

• 📊 研究支援：生物科学の研究と分析を促進する ✅

• 📄 論文アクセス: 論文コンテンツをダウンロードして読む 📝

• 📋 論文リスト: ダウンロードしたすべての論文を表示 📝

• 🗃️ ローカルストレージ: 論文はローカルに保存され、より高速にアクセスできるようになります 📝

• 📝 研究プロンプト: 論文分析のための専門的なプロンプトのセット 📝

Related MCP server: mcp-simple-arxiv

🚀 クイックスタート

前提条件

• Python 3.10以上

• FastMCPライブラリ

インストール

1. リポジトリをクローンします。

   git clone https://github.com/JackKuo666/bioRxiv-MCP-Server.git cd bioRxiv-MCP-Server

2. 必要な依存関係をインストールします。

   pip install -r requirements.txt

Smithery経由でインストール

Smithery経由で Claude Desktop 用の bioRxiv Server を自動的にインストールするには:

クロード

カーソル

次の内容を「設定」→「カーソル設定」→「MCP」→「新しいサーバーの追加」に貼り付けます。

• Mac/Linux

ウィンドサーフィン

Cライン

Claude Desktopでの使用

この設定をclaude_desktop_config.jsonに追加します。

（Mac OS）

（Windows版）:

Clineと併用

📊 使用方法

MCP サーバーを起動します。

🛠 MCP ツール

bioRxiv MCP サーバーは次のツールを提供します。

1. search_biorxiv_key_words : キーワードを使用して bioRxiv の記事を検索します。

2. search_biorxiv_advanced : 複数のパラメータを使用して bioRxiv の記事の詳細検索を実行します。

3. get_biorxiv_metadata : DOI を使用して bioRxiv 記事のメタデータを取得します。

論文の検索

次のようなクエリを使用して、AI アシスタントに論文の検索を依頼できます。

論文の詳細を取得する

DOI を取得したら、さらに詳しい情報を問い合わせることができます。

📁 プロジェクト構造

• biorxiv_server.py : FastMCP を使用したメイン MCP サーバーの実装

• biorxiv_web_search.py : bioRxivを検索するためのWebスクレイピングロジックが含まれています

🔧 依存関係

• Python 3.10以上

• ファストMCP

• 非同期

• 伐採

🤝 貢献する

貢献を歓迎します！お気軽にプルリクエストを送信してください。

📄 ライセンス

このプロジェクトは MIT ライセンスに基づいてライセンスされています。

⚠️免責事項

このツールは研究目的のみにご使用ください。bioRxivの利用規約を遵守し、責任を持ってご利用ください。