PubMed MCP サーバー

このリポジトリには、BioPythonのEntrezモジュールを使用してPubMedの論文抄録を検索するMCPサーバーが含まれています。FastMCPフレームワークを活用して、PubMedの非同期検索機能を提供します。

特徴

**PubMed を検索:**検索用語に基づいて記事を検索します。
抄録の取得: PubMed から返された記事の抄録を取得します。
**非同期操作:**サーバーのブロックを回避するために、非同期実行 ( asyncio.to_thread経由) を使用します。

Related MCP server: PubMed

前提条件

Python 3.8以上
mcp[cli]
バイオパイソン

設定

リポジトリをクローンします。
git clone https://github.com/AIAnytime/MCP-Servers cd pubmed-mcp-server
依存関係をインストールします:
uv を使用して必要なパッケージをインストールできます。
uv add -r requirements.txt
Entrez メールの設定:
コード ( main.py内) に有効なメールアドレスが設定されていることを確認します。
Entrez.email = "give an email address"

サーバーの実行

次のコマンドを実行して PubMed MCP サーバーを起動します。

uv run main.py

このコマンドは、 uvコマンドラインツール (構成で指定されたとおり) を使用してサーバーを起動します。

MCPクライアントの設定

MCP クライアントを PubMed MCP サーバーに接続するように構成するには、次のようにconfig.jsonファイルを作成または更新します。

{ "mcpServers": { "pubmed": { "command": "C:/Users/aiany/.local/bin/uv", "args": [ "--directory", "C:/Users/aiany/OneDrive/Desktop/YT Video/pubmed-mcp-server", "run", "main.py" ] } } }

構成の説明

指示：
MCP サーバーを実行するために使用されるコマンドラインツールへのフルパス (この場合はuv )。
引数:
- --directory : サーバーが配置されている作業ディレクトリを指定します。
- "C:/Users/aiany/OneDrive/Desktop/YT Video/pubmed-mcp-server" : サーバーのルートディレクトリへのパス。
- "run"と"main.py" : PubMed MCP サーバーを起動するためのコマンドとエントリポイント。