XueLab MCP Server
Click on "Deploy Server".
Wait a few minutes for the server to deploy. Once ready, it will show a "Started" state.
In the chat, type
@followed by the MCP server name and your instructions, e.g., "@XueLab MCP Serverfind recent journal papers on CRISPR and save the most relevant one"
That's it! The server will respond to your query, and you can continue using it as needed.
Here is a step-by-step guide with screenshots.
XueLab
用于个人科研工作的文献工作台:检索论文、整理中文动态、收藏与笔记、全文精读待办,以及 Markdown 稿件。网页与 MCP 工具共用同一份数据库,AI 助手可以读取任务并回写结果。
本仓库公开应用源码,不包含作者的论文库、PDF、笔记、账号、密钥或原网站部署绑定。开源不改变原网站的访问权限。
已有功能
按研究方向从 Crossref 检索近 30 天的期刊论文候选,并按 DOI 去重。
区分检索候选与经人工或助手核实的精选内容,记录来源、引用量查询日期及证据局限。
收藏论文、保存个人笔记、上传全文 PDF(最大 20 MB)。
请求全文精读,记录无法取得全文的阻碍,保存 Markdown 精读报告。
用户审阅精读并明确批准后,将论文加入稿件待办,保存和下载 Markdown 稿件。
提供
/mcpHTTP JSON-RPC 工具入口;网页与助手使用相同的读写逻辑。提供桌面和手机布局。
精读按钮只会保存待办。实际全文阅读、报告和稿件生成由外部助手完成,本项目没有内置模型 API 调用或自动后台任务。refresh_sources 只产生检索候选,不会自动生成精选早报。
Related MCP server: research-hub
技术结构
部分 | 实现 |
界面 | React、TypeScript、Tailwind CSS、shadcn 组件 |
服务端 | Vinext / Vite、Cloudflare Workers |
结构化数据 | Cloudflare D1(SQLite)、Drizzle 表结构与迁移 |
Cloudflare R2 | |
助手接口 |
|
原托管环境 | OpenAI Sites,私有站点访问控制 |
浏览器 ── /api/workspace ─┐
├── lib/xuelab.ts ── D1
AI 助手 ── /mcp ─────────┘
浏览器 ── /api/pdf ────────── R2 + D1 文件索引本地运行
需要 Node.js 22.13.0 或更新版本以及 npm。首次安装需要访问 npm 软件包源。命令在仓库根目录执行:
git clone https://github.com/jcoctnine/xuelab.git
cd xuelab
npm ci
npm run build
npm run db:init
npm run dev打开 http://127.0.0.1:5173。开发服务默认只绑定本机;本地 D1/R2 使用模拟存储,不会连接作者的生产数据。首次打开是空文献库,可在设置中调整研究方向,再刷新文献候选。
db:init 根据构建生成的配置创建本地表结构,只应在全新的本地数据库执行一次。开发态和构建预览使用 Wrangler 的本地状态目录。删除 .wrangler/ 会丢失对应的本地数据。
检查和预览生产构建:
npm run typecheck
npm run build
npm run startnpm run start 是本机 Workers 预览,不会发布网站。npm run lint 保留为开发辅助命令;当前源码没有完成全面 lint 清理。
认证与部署边界
本版本是单人工作台,不是开放注册的多用户服务。
原生产站点的身份验证与访问限制由 Sites 网关提供。应用本身没有邮箱注册、密码登录、用户表或逐用户数据隔离。/api/workspace、/api/pdf 和 /mcp 没有独立的认证中间件;app/chatgpt-auth.ts 是 Sites 身份辅助代码,不等于这些路由已自行保护。
迁移到其他托管平台前,必须为网页、数据接口、PDF 和 MCP 设置可信访问控制。不要把本地开发服务、模拟登录或未加保护的 Worker 直接暴露到公网。开放注册还需要另行实现账号体系、数据归属和逐用户授权。
.openai/hosting.json 只保留逻辑资源绑定,不带作者的 project_id。若使用 Sites,需注册自己的站点并配置自己的 D1/R2;源码不会自动连接原站点。其他部署环境需提供等价绑定及认证,仓库目前不提供一键公开部署。
MCP 与精读流程
/mcp 提供初始化、工具发现和调用接口。主要工具:
get_workspace/get_paper:读取论文、待办与报告。refresh_sources/ingest_papers:检索候选或保存已核实文献信息。set_saved/save_note/save_settings:收藏、笔记及研究方向。request_reading/complete_reading/report_reading_blocker:精读待办、报告及全文障碍。approve_article/complete_article:用户批准后制作并保存稿件。set_schedule_status:保存已由外部调度器确认的计划状态;它本身不会创建计划。
正常流程为:请求精读 → 助手实际阅读全文 → 保存报告 → 用户审阅并批准 → 助手保存稿件。没有全文时应记录阻碍,不能把摘要改写成“已完成全文精读”。保存稿件不会自动发布到公众号或其他平台。
跨设备同步依赖连接同一个托管实例。连接 MCP 的助手是否会自动读取待办,取决于外部任务触发或调度;网页不会自行唤醒助手。
目录
app/ 页面、样式、API 与 MCP 路由
lib/xuelab.ts 论文与任务状态逻辑
db/ 数据表定义
drizzle/ 数据库迁移(只有表结构)
build/ Workers 与 Sites 构建适配
scripts/ 开发、安装及构建脚本
components/ UI 组件
vendor/ 上游样式及许可证
.openai/hosting.json 不含实际站点 ID 的绑定配置开源范围与许可证
XueLab 原创代码采用 MIT License。软件依赖及第三方代码保留各自许可证,详见 THIRD_PARTY_NOTICES.md。论文、PDF、原始图表等外部内容不属于本项目软件许可证的授权范围。
不要提交 .env*、.wrangler/、.sites-runtime/、数据库导出、私人 PDF、访问令牌或本机日志。贡献代码前请运行类型检查和构建,并保持全文证据、用户批准及数据访问边界明确。
This server cannot be deployed
Maintenance
Related MCP Connectors
AI research library. Save, organise and reuse notes and webpages as clean markdown context.
Academic literature search, retrieval, and private library management on top of OpenAlex.
Personal context for every AI: search, read, and write back to your private Markdown library.
Search arXiv/Semantic Scholar/OpenAlex + medical evidence (PubMed/Europe PMC) + LaTeX/PDF tools.
Related MCP Servers
- FlicenseNot gradedqualityDmaintenanceEnables semantic search and conversational querying across a personal research library of PDFs, DOCX, and other documents using a vector database. It provides tools for document summarization, finding related papers, and high-accuracy retrieval for AI clients like Claude Desktop.-
- AlicenseBqualityAmaintenanceAI-operable research workspace integrating Zotero, Obsidian, and NotebookLM. Search papers (arXiv/Semantic Scholar/PubMed/CrossRef), ingest into Zotero, sync per-paper notes to Obsidian, verify NotebookLM briefs. All three external tools optional.76139 PyPI59MIT
- AlicenseAqualityBmaintenanceProvides local academic literature search and writing support by querying OpenAlex, arXiv, and Crossref, downloading open-access PDFs, extracting IMRaD sections, and appending BibTeX references.42MIT
- AlicenseNot gradedqualityAmaintenanceEnables AI agents to create verifiable, replayable citations, search private knowledge bases, and publish Markdown with verified citation markers.MIT