Europe PMC Literature Search MCP Server

搜索 Europe PMC 文献数据库（高性能优化版本）

功能说明：

• 使用异步方式在 Europe PMC 数据库中搜索学术文献

• 支持并发请求处理，性能比同步版本更优

• 集成缓存机制，重复查询响应更快

• 支持复杂搜索语法（如："cancer AND therapy"）

参数说明：

• keyword: 必需，搜索关键词，支持布尔运算符（AND、OR、NOT）

• email: 可选，提供邮箱地址以获得更高的API速率限制

• start_date: 可选，开始日期，格式：YYYY-MM-DD

• end_date: 可选，结束日期，格式：YYYY-MM-DD

• max_results: 可选，最大返回结果数量，默认10，最大100

返回值说明：

• articles: 文献列表，包含完整的文献信息

• total_count: 总结果数量

• search_time: 搜索耗时（秒）

• cache_hit: 是否命中缓存

• performance_info: 性能统计信息

• message: 处理信息

• error: 错误信息（如果有）

使用场景：

• 大批量文献检索

• 需要高性能的搜索任务

• 复杂的搜索查询

• 频繁的重复查询

性能特点：

• 比同步版本快30-50%

• 支持24小时智能缓存

• 自动重试机制

• 并发控制和速率限制

获取特定文献的详细信息（高性能优化版本）

功能说明：

• 使用异步方式根据PMID获取文献的完整详细信息

• 支持并发处理，性能更优

• 集成缓存机制，重复查询响应更快

• 自动重试和错误恢复

参数说明：

• pmid: 必需，PubMed ID（如："37769091"）

返回值说明：

• 包含与同步版本相同的字段

• 额外提供：

  • processing_time: 处理耗时（秒）

  • cache_hit: 是否命中缓存

  • performance_info: 性能统计信息

  • retry_count: 重试次数

使用场景：

• 需要高性能的文献详情获取

• 批量文献详情查询

• 大规模数据处理

性能特点：

• 比同步版本快20-40%

• 支持智能缓存

• 自动重试机制

• 并发控制

通过DOI获取参考文献列表（批量优化版本 - 基于Europe PMC批量查询能力）

功能说明：

• 利用Europe PMC的批量查询能力获取参考文献

• 使用OR操作符将多个DOI合并为单个查询

• 相比传统方法可实现10倍以上的性能提升

• 特别适用于大量参考文献的快速获取

• 集成了发现的Europe PMC批量查询特性

参数说明：

• doi: 必需，数字对象标识符（如："10.1126/science.adf6218"）

返回值说明：

• 包含与其他版本相同的基础字段

• 额外提供：

  • optimization: 优化类型标识

  • batch_info: 批量处理信息

    • batch_size: 批量大小

    • batch_time: 批量查询耗时

    • individual_time: 单个查询预估耗时

    • performance_improvement: 性能提升倍数

  • europe_pmc_batch_query: 使用的批量查询语句

使用场景：

• 大规模参考文献获取

• 高性能批量数据处理

• 时间关键的研究任务

• 文献数据库构建

性能特点：

• 比传统方法快10-15倍

• 利用Europe PMC原生批量查询能力

• 减少API请求次数

• 降低网络延迟影响

• 最适合处理大量参考文献的场景

技术原理：

• 使用DOI:"xxx" OR DOI:"yyy"的批量查询语法

• 一次请求获取多个DOI的信息

• 显著减少API调用次数和网络开销

批量补全多个DOI的参考文献信息（超高性能版本）

功能说明：

• 同时处理多个DOI的参考文献补全

• 使用Europe PMC的批量查询API一次性获取多个DOI的详细信息

• 比逐个查询快10-15倍，适合大规模文献数据处理

• 自动去重和信息完整性检查

• 支持最多20个DOI的批量处理

参数说明：

• dois: 必需，DOI列表，最多支持20个DOI同时处理

  • 示例: ["10.1126/science.adf6218", "10.1038/nature12373"]

• email: 可选，联系邮箱，用于获得更高的API访问限制

返回值说明：

• enriched_references: 补全信息的参考文献字典，以DOI为键

• total_dois_processed: 处理的DOI总数

• successful_enrichments: 成功补全的DOI数量

• failed_dois: 补全失败的DOI列表

• processing_time: 总处理时间（秒）

• performance_metrics: 性能指标

使用场景：

• 大规模文献数据分析

• 学术数据库构建

• 批量文献信息补全

• 高性能文献处理系统

性能特点：

• 超高性能：10-15倍速度提升

• 智能批量：自动分批处理大量DOI

• 并发优化：充分利用API并发能力

• 数据一致性：自动去重和完整性检查

根据DOI获取相似文章（基于PubMed相关文章算法）

功能说明：

• 基于PubMed的相关文章算法查找与给定DOI相似的文献

• 使用NCBI eLink服务查找相关文章

• 自动过滤最近5年内的文献

• 批量获取相关文章的详细信息

参数说明：

• doi: 必需，数字对象标识符（如："10.1126/science.adf6218"）

• email: 可选，联系邮箱，用于获得更高的API访问限制

• max_results: 可选，返回的最大相似文章数量，默认20篇

返回值说明：

• original_article: 原始文章信息

  • title: 文章标题

  • authors: 作者列表

  • journal: 期刊名称

  • publication_date: 发表日期

  • pmid: PubMed ID

  • pmcid: PMC ID（如果有）

  • abstract: 摘要

• similar_articles: 相似文章列表（格式同原始文章）

• total_similar_count: 总相似文章数量

• retrieved_count: 实际获取的文章数量

• message: 处理信息

• error: 错误信息（如果有）

使用场景：

• 文献综述研究

• 寻找相关研究

• 学术调研

• 相关工作分析

技术特点：

• 基于PubMed官方相关文章算法

• 自动日期过滤（最近5年）

• 批量获取详细信息

• 完整的错误处理

搜索arXiv文献数据库（基于arXiv官方API）

功能说明：

• 基于arXiv官方API搜索预印本论文

• 支持关键词搜索和日期范围过滤

• 自动重试和错误恢复机制

• 分页获取，支持大量结果检索

参数说明：

• keyword: 必需，搜索关键词，支持复杂查询语法

• email: 可选，联系邮箱，用于获得更好的API服务

• start_date: 可选，开始日期，格式：YYYY-MM-DD

• end_date: 可选，结束日期，格式：YYYY-MM-DD

• max_results: 可选，最大返回结果数量，默认10，最大1000

返回值说明：

• articles: arXiv文章列表

  • arxiv_id: arXiv标识符

  • title: 文章标题

  • authors: 作者列表

  • category: arXiv分类

  • publication_date: 发表日期

  • abstract: 摘要

  • arxiv_link: arXiv摘要页链接

  • pdf_link: PDF下载链接

• total_count: 实际获取的文章数量

• search_info: 搜索信息

• message: 处理信息

• error: 错误信息（如果有）

使用场景：

• 预印本文献搜索

• 最新研究发现

• 计算机科学、物理学、数学等领域文献检索

• 跟踪最新研究动态

技术特点：

• 基于arXiv官方API

• 支持复杂查询语法

• 自动分页获取

• 完整的错误处理

• 支持日期范围过滤

获取引用该文献的文献信息

处理流程：

1. 使用 PubMed elink+efetch 获取引用 PMID 列表及详情。

2. 如 PubMed 未返回结果，则回退到 Europe PMC /citations 接口。

3. 返回统一结构：citing_articles、total_count、message、error。

获取期刊质量评估信息（影响因子、分区等）

功能说明：

• 先从本地缓存（journal_info.json）查询期刊信息

• 如果本地没有且提供了API密钥，则调用EasyScholar API获取

• 返回期刊的影响因子、分区、JCI等质量指标

参数说明：

• journal_name: 必需，期刊名称

• secret_key: 可选，EasyScholar API密钥（可从环境变量EASYSCHOLAR_SECRET_KEY获取）

返回值说明：

• journal_name: 期刊名称

• source: 数据来源（local_cache 或 easyscholar_api）

• quality_metrics: 质量指标字典

  • impact_factor: 影响因子

  • sci_quartile: SCI分区

  • sci_zone: SCI大区

  • jci: JCI指数

  • impact_factor_5year: 5年影响因子

• error: 错误信息（如果有）

使用场景：

• 评估期刊质量

• 选择投稿期刊

• 文献质量评估

批量评估文献的期刊质量

功能说明：

• 为文献列表中的每篇文献评估其期刊质量

• 先从本地缓存查询，没有则调用EasyScholar API

• 返回包含期刊质量信息的完整文献列表

参数说明：

• articles: 必需，文献列表（来自搜索结果）

• secret_key: 可选，EasyScholar API密钥（可从环境变量EASYSCHOLAR_SECRET_KEY获取）

返回值说明：

• evaluated_articles: 包含期刊质量信息的文献列表

• total_count: 评估的文献总数

• message: 处理信息

• error: 错误信息（如果有）

使用场景：

• 批量评估搜索结果的期刊质量

• 文献质量筛选

• 学术研究质量评估