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Glama
README.md
# fispro-mcp

Serveur [MCP](https://modelcontextprotocol.io) pour **[FisPro](https://www.fispro.org)**, le logiciel libre de systèmes d'inférence floue développé par l'INRAE et l'Institut Agro (Serge Guillaume, Brigitte Charnomordic).

Il permet à un assistant compatible MCP — Claude Desktop, Claude Code, Cursor, VS Code… — de lire vos fichiers `.fis`, d'exécuter des inférences, et surtout **d'expliquer quelles règles se déclenchent et pourquoi**. C'est là tout l'intérêt : la logique floue produit des modèles interprétables, encore faut-il pouvoir interroger cette interprétabilité en langage naturel.

```
Vous  : Pourquoi mon système recommande 55 minutes d'arrosage à 15 % d'humidité et 32 °C ?
Claude: [explain_inference] Une seule règle se déclenche, R1 (« SI humidite_sol est sec
        ET temperature est chaude »), avec une force de 0,625 — le sol est « sec » à 62,5 %
        et la température « chaude » à 100 %. Comme aucune autre règle n'est active, la
        sortie vaut exactement le conséquent de R1, soit 55.
```

## Deux dialectes `.fis`

Le format `.fis` existe en deux variantes, et le serveur lit les deux — le
dialecte est détecté à la lecture et exposé dans `describe_fis`.

| | MATLAB | FisPro natif |
|---|---|---|
| Écrit par | Fuzzy Logic Toolbox, exports tiers | **le logiciel FisPro lui-même** |
| Compteurs | `NumInputs`, `NumMFs` | `Ninputs`, `NMFs`, `Nexceptions` |
| Opérateur ET | `AndMethod` dans `[System]` | `Conjunction` dans `[System]` |
| Défuzzification | `DefuzzMethod` dans `[System]` | `Defuzzification` dans `[Output*]` |
| Agrégation | `AggMethod` | `Disjunction` dans `[Output*]` |
| Sous-ensemble | `MF1='sec':'trimf',[0 0 40]` | `MF1='sec','triangular',[0 0 40]` |
| Règle | `1 2, 4 (1) : 1` | `1, 2,        4.000 ,` |
| Formes | `trimf`, `trapmf`, `gaussmf`, `gbellmf`, `si`, `sd` | `triangular`, `trapezoidal`, `SemiTrapezoidalInf/Sup`, `door` |

En dialecte FisPro, une sortie `Nature='crisp'` porte ses conclusions
directement dans les règles (Sugeno d'ordre 0) ; une sortie `Nature='fuzzy'` se
défuzzifie sur une surface. `Disjunction` décide du sort des règles qui
partagent une conclusion : `max` les fusionne au degré le plus fort, `sum` les
additionne — un choix qui change le résultat, pas un détail.

Les opérateurs `area`, `MeanMax`, `MaxCrisp` et `sugeno` de FisPro sont calculés
analytiquement, sans discrétisation. Sur le contrôleur de chauffage de
référence, les dix combinaisons possibles donnent la même valeur que le moteur
C++ officiel, au dernier chiffre affiché.

## Deux moteurs, deux usages

| | Moteur R (`FisPro` sur CRAN) | Moteur Python (intégré) |
|---|---|---|
| Rôle | **inférence faisant foi** | introspection et explication |
| Socle | bibliothèque C++ officielle | réimplémentation lisible |
| Dépendances | R ≥ 3.6 + paquet `FisPro` | aucune |
| Explique le raisonnement | non | **oui** |

Par défaut (`backend="auto"`), le serveur utilise R s'il est disponible et bascule sinon sur Python en le signalant. Les résultats numériques restent donc traçables.

## Installation

```bash
git clone https://github.com/Kofi04/fispro-mcp.git
cd fispro-mcp
pip install -e .
```

Backend R (recommandé, optionnel) :

```r
install.packages("FisPro")
```

## Configuration du client

Dans `claude_desktop_config.json` (Claude Desktop) ou tout autre client MCP :

```json
{
  "mcpServers": {
    "fispro": {
      "command": "fispro-mcp",
      "env": {
        "FISPRO_MCP_ROOT": "/chemin/vers/vos/modeles"
      }
    }
  }
}
```

Pour Claude Code, voir la procédure d'ajout de serveurs MCP dans la [documentation officielle](https://docs.claude.com/en/docs/claude-code/mcp).

### Variables d'environnement

| Variable | Défaut | Rôle |
|---|---|---|
| `FISPRO_MCP_ROOT` | `.` | Racine autorisée. **Aucun fichier hors de cette arborescence n'est lisible.** |
| `FISPRO_MCP_RSCRIPT` | `Rscript` | Exécutable R à utiliser |
| `FISPRO_MCP_R_TIMEOUT` | `120` | Délai maximal d'un appel R, en secondes |

## Outils exposés

| Outil | Ce qu'il fait |
|---|---|
| `check_environment` | Racine autorisée, disponibilité de R et du paquet FisPro |
| `list_fis` | Inventaire des `.fis` avec entrées, sorties et nombre de règles |
| `describe_fis` | Variables, partitions floues, opérateurs, règles rédigées en français |
| `infer` | Sorties pour un vecteur d'entrées (backend `auto` / `r` / `python`) |
| `explain_inference` | Degrés d'appartenance et règles déclenchées, triées par force |
| `infer_dataset` | Inférence par lot sur un CSV, avec export optionnel |
| `validate_fis` | Audit : sous-ensembles inutilisés, prémisses dupliquées, partitions non fortes, trous de la base de règles |

Toutes les réponses d'inférence portent un champ `warnings` : ce sont les anomalies
relevées à la lecture du fichier (règle tronquée, section inconnue…). Elles ne font
pas échouer le calcul mais peuvent le fausser — lisez-les avant d'exploiter un résultat.

### Ce que `validate_fis` contrôle exactement

- **Partitions** : la somme des degrés d'appartenance est échantillonnée en 101 points
  sur le domaine de chaque entrée. Un creux signale une partition non forte, une somme
  nulle une zone qu'aucun sous-ensemble ne représente, une somme supérieure à 1 un
  recouvrement excessif.
- **Base de règles** : l'espace d'entrée est balayé sur une grille (budget de 4096 points,
  réparti sur les axes) pour repérer les régions où aucune règle ne se déclenche — celles
  où le système ne sait rien répondre.
- **Cohérence** : sous-ensembles jamais employés en prémisse, prémisses dupliquées,
  plages invalides.

S'y ajoutent une ressource `fispro://systems` (inventaire) et une invite `audit_prompt` (audit guidé d'un modèle).

## Exemple

Le dépôt contient `tests/data/irrigation.fis`, un système Sugeno à deux entrées (humidité du sol, température) et une sortie (durée d'arrosage) :

```bash
FISPRO_MCP_ROOT=tests/data fispro-mcp
```

## Limites, en toute franchise

- **Le lecteur `.fis` reste le maillon fragile.** Les deux dialectes sont couverts et les 15 fichiers d'exemple livrés avec FisPro se lisent sans avertissement, mais le format admet des variantes que ce lecteur ne connaît peut-être pas. Tout ce qu'il ne comprend pas atterrit dans `warnings` plutôt que d'être deviné en silence — lisez-les. Si vos fichiers déclenchent des avertissements, ouvrez une issue avec un extrait anonymisé : c'est la contribution la plus utile au projet.
- **Le moteur Python couvre un sous-ensemble des fonctions d'appartenance** : `trimf`, `trapmf`, `gaussmf`, `gbellmf`, `si`, `sd`, `universal` côté MATLAB ; `triangular`, `trapezoidal`, `SemiTrapezoidalInf/Sup`, `door` côté FisPro ; et les conséquents `constant` / `linear`. Les formes `sinus`, `discrete` et `gaussian` de FisPro ne sont pas implémentées : elles lèvent une erreur explicite plutôt que de renvoyer un nombre faux.
- **`MeanMax` a un cas limite connu.** L'opérateur est reproduit comme la moyenne de l'alpha-coupe de la conclusion la mieux notée, écrêtée à `min(1, degré)`. Sur les 150 lignes du jeu iris et les onze systèmes d'exemple de FisPro, une seule inférence diverge (`configfpa.fis`, ligne 107, 2,00 contre 2,49) : deux conclusions y sont presque à égalité et FisPro semble alors agréger différemment. Les autres opérateurs sont exacts.
- **Côté Mamdani MATLAB, la défuzzification reste discrétisée.** La grille est adaptée à la finesse de la partition de sortie, mais `centroid` demeure une approximation ; attendez-vous à un écart de l'ordre du pas de grille. Les systèmes en dialecte FisPro, eux, ne passent pas par la grille.
- **Pas d'apprentissage automatique.** Induction de règles, génération de partitions, réduction d'espace : ces algorithmes vivent dans la bibliothèque C++ et ne sont pas exposés par le paquet R. Les brancher demanderait un binding pybind11 ou un appel aux exécutables en ligne de commande — c'est la prochaine étape naturelle du projet.
- **Le serveur lit et calcule ; il n'écrit pas de `.fis`.** Concevez vos systèmes dans FisPro, exploitez-les ici.

## Développement

```bash
pip install -e ".[dev]"
pytest          # sans dépendance à R
ruff check .
```

Arborescence :

```
src/fispro_mcp/   config.py, fis_model.py, inference.py, r_backend.py, server.py
tests/            tests unitaires + tests/data/irrigation.fis
```

## Licence

Code de ce serveur : MIT (voir `LICENSE`).

FisPro lui-même est distribué sous licence **CeCILL** et n'est pas redistribué ici : le backend R appelle une installation que vous réalisez vous-même. Si vous publiez des travaux s'appuyant sur FisPro, citez Guillaume & Charnomordic, *Fuzzy Inference Systems: an integrated modelling environment for collaboration between expert knowledge and data using FisPro*, Expert Systems with Applications 39(10), 2012.

Ce projet n'est pas affilié à l'INRAE ni aux auteurs de FisPro.

TDQS

A4/5.0

Scored across 7 tools

Disambiguation5/5

Each tool has a clearly distinct purpose: environment check, file listing, system description, single inference, inference explanation, dataset inference, and validation. There is no overlap; even infer and explain_inference are clearly separated by output (results vs. reasoning).

Naming Consistency5/5

All tool names follow a consistent snake_case verb_noun or verb pattern (check_environment, list_fis, describe_fis, infer, explain_inference, infer_dataset, validate_fis). The only minor deviation is the bare verb 'infer', but it is clean and understandable in context.

Tool Count5/5

Seven tools is a well-scoped count for a fuzzy inference system server. Each tool covers a distinct operation needed to work with FIS files, and none feel redundant or excessive.

Completeness5/5

The tool surface covers the full workflow for the domain: preparing/checking the environment, discovering and inspecting FIS files, running single and batch inferences, understanding inference results, and validating system integrity. No obvious dead ends or missing core operations.

Maintenance

ActivitySlowing
ResponsivenessNo issues