Servidor MCP de ensayos clínicos de AACT

Descripción general

Una implementación de servidor del Protocolo de Contexto de Modelo (MCP) que proporciona acceso a la base de datos AACT (Análisis Agregado de ClinicalTrials.gov) mediante el marco FastMCP. Este servidor permite a los asistentes de IA consultar directamente los datos de ensayos clínicos de la base de datos ClinicalTrials.gov.

Características

Herramientas

• list_tables

  • Obtenga una descripción general de todas las tablas disponibles en la base de datos AACT

  • Útil para comprender la estructura de la base de datos antes del análisis.

• describe_table

  • Examinar la estructura detallada de una tabla AACT específica

  • Muestra los nombres de las columnas y los tipos de datos

  • Ejemplo: {"table_name": "studies"}

• read_query

  • Ejecutar una consulta SELECT en la base de datos de ensayos clínicos de AACT

  • Manejar consultas SQL de forma segura con validación

  • Ejemplo: {"query": "SELECT nct_id, brief_title FROM ctgov.studies LIMIT 5"}

• append_insight

  • Registrar los hallazgos y conocimientos clave descubiertos durante el análisis

  • Ayuda a construir una narrativa analítica

  • Ejemplo: {"finding": "Phase 3 oncology trials have increased by 15% over the last 5 years"}

Recursos

• schema://database

  • Devuelve el esquema de la base de datos como un recurso JSON

• memo://insights

  • Devuelve una nota formateada de información recopilada durante la sesión.

Configuración

Variables de entorno requeridas

• DB_USER : Su nombre de usuario de la base de datos AACT

• DB_PASSWORD : Su contraseña de la base de datos AACT

Uso con núcleo semántico

Ejemplos de indicaciones

A continuación se muestran algunos ejemplos de indicaciones para utilizar con este complemento:

1. "¿Cuáles son los tipos de intervenciones más comunes en los ensayos clínicos de cáncer de mama?"

2. "¿Cuántos ensayos clínicos de fase 3 se completaron en 2023?"

3. Muéstrenme las estadísticas de inscripción para ensayos clínicos sobre diabetes en diferentes países.

4. "¿Qué porcentaje de ensayos oncológicos han reportado resultados en los últimos 5 años?"

Detalles de implementación

Este servidor está construido utilizando:

• FastMCP para la implementación del Protocolo de Contexto de Modelo

• Python psycopg2 para la conectividad de bases de datos PostgreSQL

• Base de datos AACT como fuente de datos para la información de ClinicalTrials.gov

Licencia

Licencia MIT

Contribuyendo

¡Agradecemos sus contribuciones! Por favor:

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• Correo electrónico: jonas.walheim@navis-bio.com

Expresiones de gratitud

Este proyecto se inspiró y se basó inicialmente en el código de:

• Servidor SQLite MCP

• Servidor MCP de DuckDB

• OpenDataMCP

¡Gracias a estos increíbles proyectos por mostrarnos el camino! 🙌