"""
Genome MCP - 优化版本：智能基因组数据访问
基于Linus Torvalds设计理念的简洁实现：
- 3个智能工具替代原有8个工具
- 自动识别查询意图
- 批量API优化
- 自然语言搜索支持
- 进化生物学数据分析
"""
__version__ = "0.2.5"
# 核心组件导出
from .core import (
EnsemblClient,
NCBIClient,
ParsedQuery,
QueryExecutor,
QueryParser,
QueryType,
UniProtClient,
analyze_gene_evolution,
build_phylogenetic_profile,
)
# 兼容性导出（保持向后兼容）
from .core.tools import _apply_filters, _format_simple_result, _query_executor
# MCP工具导出（主要接口）
# 注意：所有MCP工具通过 FastMCP 框架自动注册
__all__ = [
# 版本信息
"__version__",
# 核心类
"QueryParser",
"QueryExecutor",
"NCBIClient",
"UniProtClient",
"EnsemblClient",
"ParsedQuery",
"QueryType",
"_query_executor",
# 进化分析工具
"analyze_gene_evolution",
"build_phylogenetic_profile",
# 辅助函数
"_format_simple_result",
"_apply_filters",
]