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Glama

raras

Server Details

Disease Twin — Brazil's rare-disease knowledge graph (10,468) over MCP. Source-grounded, PT-BR.

Status
Healthy
Last Tested
Transport
Streamable HTTP
URL
Repository
rarasAI/raras
GitHub Stars
0

Glama MCP Gateway

Connect through Glama MCP Gateway for full control over tool access and complete visibility into every call.

MCP client
Glama
MCP server

Full call logging

Every tool call is logged with complete inputs and outputs, so you can debug issues and audit what your agents are doing.

Tool access control

Enable or disable individual tools per connector, so you decide what your agents can and cannot do.

Managed credentials

Glama handles OAuth flows, token storage, and automatic rotation, so credentials never expire on your clients.

Usage analytics

See which tools your agents call, how often, and when, so you can understand usage patterns and catch anomalies.

100% free. Your data is private.

Tool Definition Quality

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Available Tools

21 tools
analyze_clinical_caseAnalisar caso clínico
Read-only
Inspect

Caso clínico → doenças candidatas + literatura relevante em 1 chamada. Apenas informativo, nunca diagnóstico.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
papers_limitNo
diseases_limitNo
case_descriptionYes
explain_relationExplicar relação (MedGraphRAG, raciocínio multi-hop)
Read-only
Inspect

Raciocínio fundamentado sobre o grafo: dada uma pergunta (ex.: "por que o gene X se associa à doença Y?", "como a droga Z se relaciona a esta doença?"), retorna caminhos de evidência multi-hop (doença↔gene↔via↔droga↔fenótipo) com proveniência citável. Se não houver caminho no grafo, recusa — nunca inventa.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
queryYes
hpo_idsNo
max_hopsNo

Output Schema

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescription
pathsYes
queryYes
summaryYes
hasEvidenceYes
find_active_trialsEnsaios clínicos ativosInspect

Trials ativos com filtro Brazil.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
limitNo
orphaCodeYes
in_brazil_onlyNo
find_communitiesComunidades de pacientesInspect

Comunidades FEBRARARAS por doença.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
limitNo
orphaCodeYes
find_diseases_by_phenotypesBuscar doenças por fenótiposInspect

Match por IDs HPO. Use para diagnóstico diferencial.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
limitNo
hpo_idsYes
find_papers_for_diseasePapers de uma doençaInspect

Literatura relacionada a uma doença via embeddings (:SEMANTIC_MATCH, fallback vetorial).

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
limitNo
min_scoreNo
orphaCodeYes
find_phenotypically_similarDoenças com fenótipos similares
Read-only
Inspect

Doenças com perfil de fenótipos HPO semelhante (simGIC pré-computado, explicável: nº de fenótipos em comum). Complementa find_similar_diseases (semântico).

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
limitNo
orphaCodeYes

Output Schema

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescription
methodYes
resultsYes
orphaCodeYes
find_reference_centersCentros de referênciaInspect

Centros por doença e/ou UF, com CNES.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
limitNo
stateNo
orphaCodeNo
find_similar_diseasesDoenças similaresInspect

Vector similarity via embeddings SOTA.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
limitNo
orphaCodeYes
get_disease_detailDetalhes de doença raraInspect

Fenótipos HPO, genes, SUS, trials, descrição clínica em PT.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
orphaCodeYes
get_evidenceProveniência / evidências
Read-only
Inspect

Cross-references de autoridade (Orphanet, MONDO, OMIM, MeSH, GARD, UMLS), status de verificação e PMIDs de uma doença. A base da regra "nunca inventar".

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
orphaCodeYes

Output Schema

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescription
nameYes
pmidsYes
xrefsYes
orphaCodeYes
diseaseTwinYes
neverInventYes
verificationYes
get_graph_statsEstatísticas do grafoInspect

Contagens e métricas do dataset.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault

No parameters

get_hypothesesHipóteses de reposicionamento (co-scientist)
Read-only
Inspect

Candidatos a reposicionamento de fármacos gerados por associação de genes (guilt-by-association): drogas que tratam outras doenças que compartilham genes com esta. HIPÓTESES para investigação, NUNCA recomendações clínicas — cada uma rastreável (via gene X, da doença Y).

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
orphaCodeYes

Output Schema

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescription
nameYes
methodYes
orphaCodeYes
hypothesesYes
isRecommendationYes
get_literature_relationsRelações mineradas da literatura (PubTator3)
Read-only
Inspect

Relações tipadas extraídas da literatura biomédica (associate/treat/cause/inhibit/stimulate/prevent) entre a doença e genes/fármacos, com nº de publicações como proveniência. Filtrável por predicado.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
orphaCodeYes
predicateNo

Output Schema

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescription
sourceYes
orphaCodeYes
relationsYes
get_recent_updatesDisease Twins atualizados recentemente
Read-only
Inspect

Doenças cujo gêmeo digital ganhou evidência nova (autoria, PubTator3, Open Targets, verificação) nos últimos N dias. Faça polling para acompanhar mudanças (substituto stateless de subscriptions).

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
daysNo
limitNo

Output Schema

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescription
updatesYes
sinceDaysYes
get_research_logDiário de pesquisa do Disease Twin
Read-only
Inspect

Registro cronológico do que o agente autônomo fez por esta doença: autoria, mineração de literatura, evidência genética, verificação, prospecção de fontes, recomputação de relações. Prova de que o gêmeo digital estuda a doença continuamente.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
orphaCodeYes

Output Schema

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescription
nameYes
eventsYes
orphaCodeYes
get_schemaEsquema do grafo
Read-only
Inspect

Node labels, relationship types e property keys do grafo. Use antes de cypher_query.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault

No parameters

get_sus_coverageCobertura SUSInspect

CEAF, SIGTAP, PNTN, nível de integração.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
orphaCodeYes
search_diseasesBuscar doenças rarasInspect

Full-text search em 10.468 doenças raras. Suporta filtros SUS/trials.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
limitNo
queryYes
filter_has_sus_coverageNo
filter_has_active_trialsNo
search_papers_semanticBusca semântica de papersInspect

Busca vetorial sobre 424k papers do PubMed. Use caso clínico, pergunta ou conjunto de sintomas.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
limitNo
queryYes
min_scoreNo
search_phenotypesBuscar fenótipos HPOInspect

Lookup HPO em PT ou EN. Retorna IDs HP:.

ParametersJSON Schema
NameRequiredDescriptionDefault
limitNo
queryYes

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