alterios-mcp
This server provides tools for inventorying, inspecting, and interacting with Alterios/LIMS instances, supporting both read-only exploration and controlled write operations.
Configuration & Discovery
alterios_config– View the current redacted Alterios profile configuration and identify missing required valuesalterios_discover_readonly– Probe a live matrix of known safe read-only REST routes on an Alterios instance
Project & Object Inventory
alterios_list_projects– List all projects on the configured Alterios instancealterios_list_objects– Inventory common Alterios object types vialistandcountroutesalterios_list_fields– List content type fields, optionally filtered by content type or field IDalterios_list_groups– Inventory project groupsalterios_list_comments– List comments for an entity with depth and pagination
Views & Forms
alterios_get_view– Read a full view object by IDalterios_view_entities– Read entity/join configuration for a viewalterios_view_fields_populated– Read populated field metadata for a viewalterios_view_data– Read view rows with optionalcontent_id,data_id, anduser_filtersalterios_view_data_simplified– Read a view via the simplifiedget-data-simplifiedendpointalterios_get_form– Read a full form object by ID
Reporting & Files
alterios_report_full– Read a full report by IDalterios_file_metadata– Retrieve metadata for one or more file IDs
Script Services & REST
alterios_service_catalog– Browse known script-service functions with read/write labels, risk levels, and argument hintsalterios_call_readonly_service– Call known read-only script-service functions (e.g.,getTasks,getContents,getViewData)alterios_rest_get– Run read-only GET requests against any/api/...route
Controlled Write Operations (disabled by default; require ALTERIOS_MCP_ALLOW_WRITE=1 and dry_run=false)
alterios_call_write_service– Plan or execute a mutating script-service function (dry-run by default)alterios_rest_write– Plan or run a mutating REST request (POST/PUT/PATCH/DELETE; dry-run by default)alterios_execute_manual_script– Plan or execute a saved script by UUID; destructive operations additionally requireallow_destructive=true
Provides tools for managing BPMN processes, tasks, and scripts, integrating with Camunda workflow engine for process automation in Alterios.
Click on "Install Server".
Wait a few minutes for the server to deploy. Once ready, it will show a "Started" state.
In the chat, type
@followed by the MCP server name and your instructions, e.g., "@alterios-mcplist all projects from my alterios instance"
That's it! The server will respond to your query, and you can continue using it as needed.
Here is a step-by-step guide with screenshots.
alterios-mcp
alterios-mcp - MCP-сервер для чтения, проектирования, управляемой записи и
проверки проектов Alterios/LIMS из Codex и других MCP-клиентов.
Сервер рассчитан на несколько экземпляров Alterios и множество проектов внутри
каждого экземпляра. Основной рабочий контур: инвентаризация -> постановка ->
dry-run -> проверенный plan_id -> запись -> API/UI readback -> приватный отчёт
о результате.
Текущая версия: 0.2.4. Публичный registry содержит 109 MCP tools:
live - 82, discovery - 56, admin - 107, full - 109.
Основные возможности
проекты, типы материалов, поля, контент и файлы;
представления, связи, view entities, поля, фильтры и форматы отображения;
формы, вкладки, строки, ячейки, listeners и действия;
Google Fonts Icons с проектным registry и загрузкой в файловый менеджер;
web/cron/manual/event/library/diagram scripts и их аргументы;
BPMN, процессы, задачи,
camunda:formKeyи проверка side effects;Project Database reports, Stimulsoft templates и printable render/PDF check;
users, user groups, roles и destructive operations через отдельные gates;
сценарные операции для модулей материалов, отчётных вкладок и процессов;
private Gitea work items, agent handoffs и stage labels;
cached project health, write plans, journal, replay smoke и runtime fingerprint.
Полная матрица: docs/alterios-method-coverage.md.
Related MCP server: Kroki MCP
Быстрый старт
1. Установка готового релиза
Требуется Python 3.11 или новее.
$manager = "$env:LOCALAPPDATA\alterios-mcp\manage_release.ps1"
New-Item (Split-Path $manager) -ItemType Directory -Force | Out-Null
Invoke-WebRequest `
"https://github.com/SayAMSTASI/alterios-mcp/releases/latest/download/manage_release.ps1" `
-OutFile $manager
& $manager -Action Install -DotenvPath "C:\path\to\private\alterios.env"Менеджер сам скачивает wheel последнего GitHub Release, проверяет wheel и свою
обновлённую копию по SHA256SUMS.txt, создаёт окружение, устанавливает MCP и
запускает doctor и release smoke. Он сохраняется в постоянном каталоге
пользователя.
Последующие обновления выполняются одной командой:
& "$env:LOCALAPPDATA\alterios-mcp\manage_release.ps1" -Action UpdateПеред обновлением закройте Codex или другой MCP-клиент. Если это неудобно,
добавьте -StopRunningMcp: менеджер остановит только процессы из своей .venv.
Предыдущий release wheel сохраняется и используется для автоматического
rollback, если doctor или release smoke после обновления не пройдут.
Проверить наличие версии и получить варианты исправления можно без записи:
& "$env:LOCALAPPDATA\alterios-mcp\manage_release.ps1" -Action Check
& "$env:LOCALAPPDATA\alterios-mcp\manage_release.ps1" -Action SolutionsДля разработки из исходного кода:
git clone https://github.com/SayAMSTASI/alterios-mcp.git
cd alterios-mcp
python -m venv .venv
.\.venv\Scripts\python.exe -m pip install -e ".[dev]"Для фиксированной версии или автономной установки можно передать менеджеру URL или локальный путь к wheel. После любой операции перезапустите MCP-клиент: работающий процесс не перечитывает пакет и registry автоматически.
.\manage_release.ps1 -Action Update `
-Package "C:\packages\alterios_mcp-0.2.4-py3-none-any.whl" `
-ExpectedSha256 "<sha256>" `
-DotenvPath "C:\path\to\private\alterios.env"1.1. Предложения по устранению проблем
Команда alterios-suggest-fixes запускает read-only диагностику и возвращает
для каждой ошибки несколько вариантов решения: рекомендуемый путь,
альтернативу, готовую команду, уровень риска и необходимость перезапуска.
& "$env:LOCALAPPDATA\alterios-mcp\venv\Scripts\alterios-suggest-fixes.exe" `
--require-config --processes2. Приватная конфигурация
Скопируйте структуру из .env.example в файл вне репозитория. Не коммитьте
токены, cookie, реальные адреса и идентификаторы проектов.
ALTERIOS_PROFILE=primary
ALTERIOS_PROFILES=primary,secondary
ALTERIOS_PRIMARY_BASE_URL=https://alterios-primary.example.local
ALTERIOS_PRIMARY_API_TOKEN=replace-me
ALTERIOS_PRIMARY_AUTH_HEADER=x-api-key
ALTERIOS_PRIMARY_AUTH_SCHEME=
ALTERIOS_PRIMARY_TIMEOUT_SECONDS=20
ALTERIOS_SECONDARY_BASE_URL=https://alterios-secondary.example.local
ALTERIOS_SECONDARY_API_TOKEN=replace-me
ALTERIOS_SECONDARY_AUTH_HEADER=Authorization
ALTERIOS_SECONDARY_AUTH_SCHEME=Bearer
ALTERIOS_SECONDARY_TIMEOUT_SECONDS=20
ALTERIOS_MCP_TOOL_PROFILE=live
ALTERIOS_MCP_ALLOW_WRITE=0
ALTERIOS_MCP_ALLOW_DANGEROUS_WRITE=0
ALTERIOS_MCP_REQUIRED_AGENT_ROLES=analyst,implementer,verifierОдин профиль описывает один экземпляр Alterios. Проект для каждой операции
передаётся явным project_id; default project в профиле используется только
как локальное удобство, а не как скрытая маршрутизация записи.
3. Подключение к Codex
Используйте установленный console entry point. Не создавайте несколько
одинаковых записей mcp_servers.alterios, иначе клиент запустит несколько
экземпляров сервера.
[mcp_servers.alterios]
command = "C:\\Users\\<user>\\AppData\\Local\\alterios-mcp\\venv\\Scripts\\alterios-mcp.exe"
args = []
startup_timeout_sec = 60
tool_timeout_sec = 120
[mcp_servers.alterios.env]
ALTERIOS_DOTENV_PATH = "C:\\path\\to\\private\\alterios.env"
ALTERIOS_MCP_TOOL_PROFILE = "live"Локальная диагностическая команда:
$env:ALTERIOS_DOTENV_PATH = "C:\path\to\private\alterios.env"
& "$env:LOCALAPPDATA\alterios-mcp\venv\Scripts\alterios-mcp.exe"Для MCP config не используйте python -m alterios_mcp.server: console script
является единственной рекомендуемой точкой запуска. Python module entry point
оставлен только для совместимости и диагностики.
4. Проверка после установки
& "$env:LOCALAPPDATA\alterios-mcp\venv\Scripts\alterios-doctor.exe" --require-config --json
& "$env:LOCALAPPDATA\alterios-mcp\venv\Scripts\alterios-profile-smoke.exe" --json
& "$env:LOCALAPPDATA\alterios-mcp\venv\Scripts\alterios-replay-smoke.exe" --jsonПеред записью в конкретный проект:
.\.venv\Scripts\alterios-project-health.exe `
--profile <profile> `
--project-id <project-id> `
--refresh `
--json `
--prettyПрофили MCP tools
Профиль | Tools | Назначение |
| 82 | Основной профиль: health, scenarios, typed writes и проверка результата |
| 56 | Read-only исследование, inventory и validators |
| 107 | Администрирование, security и controlled destructive operations |
| 109 | Разработка MCP и исследование неизвестных routes |
Профиль выбирается до запуска процесса через ALTERIOS_MCP_TOOL_PROFILE.
Для обычных задач используйте live. full не является режимом повышенного
качества и не нужен для повседневной работы.
Подробнее: docs/mcp-tool-profiles.md.
Управляемая запись
Запись по умолчанию выключена. Без выполнения gate-условий tools возвращают план или audit и не отправляют изменяющий запрос.
Обычная запись требует:
Явные
profileиproject_id.Успешный
alterios_live_task_preflight.Dry-run и проверенный
plan_id, если сценарий поддерживает планы.ALTERIOS_MCP_ALLOW_WRITE=1в окружении MCP-процесса.Apply с теми же аргументами и
plan_id.API readback и UI/render check для пользовательской поверхности.
Запись результата в private Gitea, без публикации project evidence в GitHub.
Security/delete дополнительно требуют:
ALTERIOS_MCP_ALLOW_DANGEROUS_WRITE=1и allow_destructive=true в tool call. Перед неизвестным route используйте
alterios_write_safety_preflight.
Подробно: docs/controlled-writes.md.
Сценарные tools
Модуль материала
alterios_create_material_module создаёт согласованный набор:
тип материала и поля;
experimental view, entity и view fields;
list/add/edit/detail forms;
группу меню и project-local icons;
dry-run plan и readback.
Вкладка отчёта
alterios_create_report_tab связывает source view, Project Database report и
form tab, проверяет openId/dataId, template layout и readback. Печатный
результат проверяется alterios_validate_printable_render.
При apply без явного template сценарий берет точный шаблон из сохраненного
dry-run плана; передавать сгенерированный Stimulsoft JSON повторно вручную не нужно.
alterios_diagnose_report_viewer раздельно проверяет source view, тип и шаблон
Stimulsoft, layout, привязку report-ячейки формы, printable PDF и evidence
браузерного viewer-контейнера. Отсутствие browser evidence возвращается как
явное предупреждение, а не маскируется успешным API readback.
Процесс
alterios_create_process_flow связывает task form, scripts, BPMN XML,
camunda:formKey, запуск процесса и task/process readback.
Массовые операции
alterios_bulk_update_selected_content_fields- обновление полей выбранных записей;alterios_fast_live_bulk_manual_script- manual script по выбранным ID;alterios_fast_live_bulk_process- BPMN process по выбранным ID;alterios_fast_live_bulk_delete- destructive delete только вadmin/full.
UX-контракт
Формы и сценарные tools проверяются не только по JSON-схеме, но и по пользовательским правилам:
представления по умолчанию создаются в experimental mode;
для add/edit/list/detail создаются отдельные формы с понятными заголовками;
формы используют фильтр по текущему полю/
openId, когда это требуется связью;технические и неинформативные столбцы скрываются;
footnote используется только для поля даты;
действия элемента оформляются project-local icon + tooltip;
три и более вторичных действий группируются в меню;
табличный заголовок центрирован и выделен bold;
нетабличная ячейка не получает лишний заголовок;
iconIdвсегда относится к файлу текущего проекта.
Проверка одной формы: alterios_validate_form_contract. Единая проверка типа
материала, полей, view/joins, add/edit/view/list форм, иконок, bulk и отчетов:
alterios_validate_module_contract. Источник правил:
docs/ux-contract.md и
docs/ux-contract.json.
Матрица происхождения правил из skills и граница между блокирующими,
evidence-gated и рекомендательными требованиями:
docs/ux-contract-skill-matrix.md.
Архитектура 0.2
server.py больше не содержит бизнес-логику. Он создаёт FastMCP, регистрирует
домены, применяет tool profile и запускает transport.
src/alterios_mcp/
|- server.py composition root
|- tools/ 12 registration-модулей по доменам
|- scenarios/ orchestration, dry-run/apply/readback workflows
|- builders/ чистое построение payload и UI fragments
|- validators/ чистые проверки контрактов
|- client.py HTTP client и route variants
|- tool_profiles.py live/discovery/admin/full registry
|- write_plan.py plan_id и проверка apply
`- runtime_info.py fingerprint процесса и диагностика запускаПравила развития:
Бизнес-операция создаётся в
scenarios/.Payload и validation выносятся в
builders/иvalidators/.tools/<domain>.pyсодержит только регистрацию public callable.Tool name и schema являются совместимым публичным контрактом.
Изменение registry требует обновления golden snapshot.
После изменения обязательны pytest, replay smoke и public-tree scan.
Подробнее: docs/architecture.md.
Агенты и private workboard
Рабочий delivery-контур использует три обязательные роли:
Роль | Ответственность |
| Постановка, Mermaid-схема, модель данных и acceptance criteria |
| Реализация, dry-run/apply и артефакты |
| Независимые tests, readback, UI/render и риски |
PM ведёт private Gitea issue и stage:*, но не блокирует каждую техническую
операцию. Реальные URL, project IDs, названия материалов, HAR и screenshots не
публикуются в открытом репозитории.
Документы:
Проверка разработки
.\.venv\Scripts\python.exe -m pytest
.\.venv\Scripts\alterios-replay-smoke.exe --json
git diff --check
.\.venv\Scripts\python.exe scripts\check_public_tree.pyRegistry защищён golden snapshot: имена tools, схемы аргументов и состав профилей не должны меняться случайно.
Runtime и лишние процессы
Один активный MCP config обычно создаёт один логический сервер. На Windows
console launcher и дочерний python.exe могут отображаться как два связанных
процесса. Большое число независимых экземпляров обычно означает старые Codex
сессии, дублирующиеся MCP configs или не завершённые transports.
Используйте alterios_runtime_info(include_processes=true) для группировки по
instance fingerprint. После обновления:
Завершите старые Codex/MCP сессии.
Убедитесь, что в config одна запись
mcp_servers.alterios.Обновите release wheel или editable package.
Перезапустите Codex.
Проверьте runtime fingerprint и
alterios_replay_smoke.
Подробнее: docs/runtime-hygiene.md.
Документация
Граница публичного репозитория
В GitHub хранятся только переиспользуемый MCP-код, тесты, обезличенные правила, skills, шаблоны и документация. Реальные бизнес-задачи, адреса систем, UUID, названия материалов, пользователи, HAR, screenshots и результаты live-write хранятся в private Gitea или локальном закрытом контуре.
Maintenance
Resources
Unclaimed servers have limited discoverability.
Looking for Admin?
If you are the server author, to access and configure the admin panel.
Related MCP Servers
- Alicense-qualityCmaintenanceA production-oriented MCP server for coding agents that enables multi-project management through secure file operations, Git integration, and safe command execution. It supports project discovery across multiple root directories and provides robust audit logging with both STDIO and HTTP transport options.Last updated272MIT
- Alicense-qualityFmaintenanceA production-ready MCP server scaffold that features built-in authentication, Docker support, and a comprehensive CI/CD release pipeline. It provides a standardized template for deploying servers with multi-transport support and configurable read-only modes.Last updatedMIT
- Alicense-qualityDmaintenanceProduction-ready MCP server for Atlassian Jira and Confluence, providing tools for issue management, page retrieval, and content operations.Last updated541MIT
- Alicense-qualityFmaintenanceA production-ready MCP server for MySQL database operations, providing secure HTTP endpoints for read-only queries, performance analysis, and server monitoring.Last updated859MIT
Related MCP Connectors
A MCP server built for developers enabling Git based project management with project and personal…
MCP server for the Inistate platform: module discovery, entry management, and activity submission.
An MCP server for deep research or task groups
Latest Blog Posts
- Who's Calling? MCP Hosts Are an Identity Blind Spot (And the Spec Knows It)By Om-Shree-0709 on .mcpAgent IdentityOAuth 2.1
- Your AI Chatbot Just Exposed Your CEO's Salary to an InternBy Om-Shree-0709 on .Agent IdentityMCP SecurityOAuth Delegation
- Why MCP Servers Need Execution Sandboxing (And Why Your Current Stack Isn't Enough)By Om-Shree-0709 on .Agentic AiPrompt InjectionWebAssembly
MCP directory API
We provide all the information about MCP servers via our MCP API.
curl -X GET 'https://glama.ai/api/mcp/v1/servers/SayAMSTASI/alterios-mcp'
If you have feedback or need assistance with the MCP directory API, please join our Discord server