Searches arXiv for scholarly papers and retrieves metadata, abstracts, and related literature information.
Searches Google Scholar for scholarly literature and related citation information.
Publishes generated Markdown reading notes and research output into an Obsidian vault, preserving local edits and placing conflict versions in a .conflicts folder.
Searches PubMed/PMC for biomedical and life sciences literature and retrieves paper details and related metadata.
Searches Semantic Scholar for papers and retrieves details such as authors, citations, references, recommendations, snippets, datasets, and journal metrics.
Reads local Zotero libraries without modifying them, providing access to collections, items, notes, annotations, attachments, indexed text, and local PDF paths.
Click on "Deploy Server".
Wait a few minutes for the server to deploy. Once ready, it will show a "Started" state.
In the chat, type @ followed by the MCP server name and your instructions, e.g., "@io.github.luffysolution-svg/omnischolar Find five recent reviews about solid-state battery interfaces, deduplicated by DOI."
That's it! The server will respond to your query, and you can continue using it as needed.
Here is a step-by-step guide with screenshots.
简体中文 | English
OmniScholar 通过本地 Python MCP 服务，为 Codex、Claude Code、Cursor、OpenCode、Hermes 和 Pi 提供文献检索、Zotero 读取、PDF 解析、引用处理、材料数据和科研绘图工具。
它可以把在线文献记录与 Zotero 笔记放在一起处理，将经你确认的 PDF 交给 MinerU 解析，再把 Markdown 保存到普通文件夹或 Obsidian Vault。Zotero 全程只读。
检索 Semantic Scholar、OpenAlex、PubMed/PMC、arXiv、Crossref、Unpaywall、easyScholar、Google Scholar 和 Google Patents
查询论文详情、作者、参考文献、施引文献、推荐、全文片段、数据集和期刊指标
读取 Zotero 收藏夹、条目、笔记、批注、附件、索引文本和本地 PDF 路径，不修改文献库
使用 MinerU 提取指定 PDF 的正文、公式、表格和图片
基于 MinerU 原文进行完整或聚焦式专业解读，结合图片视觉内容、图注和正文上下文分析图表；仅在内容过长或用户要求时保存 Markdown
查找引用候选，核对书目信息，再按要求生成参考文献
查询 Materials Project，并导出 JSON、CSV、Markdown 或 CIF
调用已配置的图片服务生成或编辑科研示意图
保留手工修改过的 Markdown，把待合并版本放入 .conflicts/
将 Zotero PDF、笔记和批注保存到每篇文献的 source/
OmniScholar 共提供 39 个工具，完整列表见工具目录。
需要 Python 3.11 或更高版本。普通 Python 命令任选一种方式安装：
uv tool install luffysolution-omnischolar
# 或
pipx install luffysolution-omnischolar
# 或
python -m pip install luffysolution-omnischolar检查、更新和卸载：
omnischolar --version
omnischolar doctor --json
uv tool upgrade luffysolution-omnischolar
uv tool uninstall luffysolution-omnischolar如果希望用一条命令强制刷新并重装最新版：
uv tool install --reinstall luffysolution-omnischolarcodex plugin marketplace add luffysolution-svg/omnischolar --ref main
codex plugin add omnischolar@omnischolar
# 更新已安装的 Codex 插件
codex plugin marketplace upgrade omnischolar
codex plugin remove omnischolar@omnischolar
codex plugin add omnischolar@omnischolarChatGPT 桌面应用中重启应用后打开 Plugins，选择 OmniScholar 并安装或启用；Codex CLI 可运行 /plugins 浏览插件。插件已经包含 Skills，并通过下面的命令启动 PyPI 最新 MCP：
uvx --refresh-package luffysolution-omnischolar --from luffysolution-omnischolar@latest omnischolar mcp在 Claude Code 会话中运行：
/plugin marketplace add luffysolution-svg/omnischolar
/plugin install omnischolar@omnischolar普通终端也可以运行：
claude plugin marketplace add luffysolution-svg/omnischolar
claude plugin install omnischolar@omnischolar --scope user
claude plugin update omnischolar@omnischolar --scope userpi install npm:@luffysolution/omnischolar-pi
pi update npm:@luffysolution/omnischolar-pi
pi remove npm:@luffysolution/omnischolar-piomnischolar install --dry-run claude
omnischolar install claude
omnischolar update claude
omnischolar uninstall claude也可以使用官方 Skills CLI 单独安装 Skills；插件已经包含这些 Skills，通常不需要重复安装：
npx skills add luffysolution-svg/omnischolar --skill '*' --agent codex --global --yes
npx skills update --global --yes
npx skills remove --skill '*' --agent codex --global --yes完整的各 Agent 路径、项目级安装和故障排查见安装说明。
Related MCP server: Crossref Academic MCP Server
可以将下面的提示词作为 Agent 的项目级指令或系统提示词基础：
你是我的科研助理，使用 OmniScholar 完成文献检索、Zotero 阅读、PDF 解析、引用核对和科研资料整理。检索时优先使用可靠的学术来源，核对 DOI 与书目信息，并明确区分原文证据、推断和不确定内容。Zotero 只允许读取，禁止修改。上传 PDF、参考图或发起可能收费的请求前必须先征得我的确认；MinerU 只有在我确认后才能上传文件。将确认后的文献笔记和生成文件保存到配置的输出目录，保留已有手工修改，并报告最终文件路径。生成的科研图片只能作为示意图，不能当作实验数据或科研证据。首次启动 MCP 或运行安装器时，如果没有可发现的配置，OmniScholar 会创建用户级 omnischolar.config.json 模板。模板中的服务默认处于启用状态；填写 API key 后即可使用对应服务，没有凭据的服务不会自动发起请求。API key 可以直接填写到 apiKey，也可以用 apiKeyEnv 指定环境变量。
填写对应 API key 并启用服务后，即可直接使用 Ai4Scholar、图片生成、MinerU 和参考图上传。
根目录的 mcp.json 是可直接复制到支持 MCP 的 Agent 中的 stdio 示例，内容如下：
{
"mcpServers": {
"omnischolar": {
"type": "stdio",
"command": "uvx",
"args": ["--refresh-package", "luffysolution-omnischolar", "--from", "luffysolution-omnischolar@latest", "omnischolar", "mcp"]
}
}
}mcp.json 只负责启动 MCP，不保存 API key；服务凭据和 Obsidian 输出位置填写在 omnischolar.config.example.json 对应字段中，可执行 omnischolar config init 创建实际配置。插件内部使用的配置文件是 .mcp.json。MinerU 原文与 Zotero 阅读记录都会写入书目信息 frontmatter，解析图片始终以 Zotero key 开头；文件夹、Markdown 文件和图片命名可通过 output 区块自定义，详见文献与输出配置。
查找 5 篇关于固态电池界面的近期综述，按 DOI 去重，并给出开放获取版本。
在我的 Zotero 中找到这个 DOI，汇总笔记和批注，不要修改 Zotero。
我确认上传后，用 MinerU 解析这份 PDF，并把阅读笔记保存到 Obsidian Vault。
查询 Materials Project 中稳定的 Li-Fe-P-O 材料，将选中的记录导出为 CSV 和 CIF。
为这个机理绘制带标签的示意图。图片只是草稿，不得写成实验数据。OmniScholar 使用 MIT License 开源。可以在 GitHub Issues 提交问题，或发送邮件到 LuffySolution@gmail.com。报告问题前，请删除 API key、签名 URL、私人论文内容和个人 Zotero 数据。
第三方服务和数据遵循各自的条款与许可证，详见 THIRD_PARTY_NOTICES.md。
This server cannot be deployed
Zotero MCP server for Claude and ChatGPT: search, citations, safe writes, PDF passages and pages.
Search GitHub, npm, PyPI, StackOverflow, ArXiv from one MCP — built for coding agents.
OCR, transcription, file extraction, and image generation for AI agents via MCP.
MCP server for Firecrawl — web search, scraping, and biomedical/arXiv paper search.