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VitalDB MCP Server

by yejelim
README.md5.04 kB
# VitalDB MCP Server - Advanced Edition VitalDB 데이터를 자연어로 탐색하고 **고급 분석**을 수행할 수 있는 Model Context Protocol (MCP) 서버입니다. ## ✨ 주요 기능 ### 🔍 1. 고급 데이터 필터링 - **통계 기반 필터링**: "평균 심박수가 100 이상인 케이스 찾기" - **조건식 지원**: `>100`, `>=80`, `<60`, `50-100` 등 - **대규모 분석**: 최대 100개 이상의 케이스 동시 처리 ### 📊 2. 일괄 분석 - **배치 처리**: 여러 케이스를 한 번에 분석 - **다중 트랙 분석**: 한 케이스의 여러 신호를 동시 분석 - **통계 추출**: 평균, 중앙값, 표준편차, 왜도, 첨도 등 ### 🔗 3. 상관관계 분석 - **두 신호 간 상관계수** 계산 - **케이스별 상관관계** 및 전체 상관관계 - **산점도 시각화** (추세선 포함) ### 📈 4. 그룹 비교 - **두 그룹 통계 비교** - **t-test 자동 수행** - **p-value 계산** 및 유의성 판단 ### 🎨 5. 고급 시각화 - **무제한 케이스 플롯**: 오버레이 또는 서브플롯 - **분포 시각화**: 히스토그램, 박스플롯, 바이올린 플롯 - **히트맵**: 시간대별 트랙 값 변화 - **상관관계 산점도**: 회귀선 포함 ### 🔬 6. 이상치 탐지 - **Z-score 방법**: 표준편차 기반 - **IQR 방법**: 사분위수 기반 - **시각화**: 이상치 위치 자동 표시 ### 📂 7. 데이터 내보내기 - **CSV 저장**: 분석 결과를 파일로 저장 - **다중 케이스/트랙** 지원 ## 🚀 설치 방법 ### 1. 의존성 설치 ```bash cd /Users/yeze-macbookair-2025/workspaces/vitaldb-mcp-server ./install.sh ``` ### 2. Claude Desktop 설정 **설정 파일 위치**: `~/Library/Application Support/Claude/claude_desktop_config.json` ```json { "mcpServers": { "vitaldb": { "command": "/Users/yeze-macbookair-2025/workspaces/vitaldb-mcp-server/venv/bin/python", "args": ["/Users/yeze-macbookair-2025/workspaces/vitaldb-mcp-server/server.py"] } } } ``` ### 3. Claude Desktop 재시작 설정 후 Claude Desktop을 완전히 종료하고 다시 시작하세요. ## 💡 실제 활용 예시 **"마취 중 평균 심박수가 100 이상이었던 환자들의 수술 중 체온 변화 특징은?"** 이런 복잡한 질문도 자연어로 가능합니다! ## 🛠️ 사용 가능한 도구 ### 기본 도구 - `find_cases`: 트랙 기반 케이스 검색 - `get_case_info`: 케이스 정보 조회 - `search_available_tracks`: 사용 가능한 트랙 목록 ### 고급 분석 - `filter_cases_by_statistics`: 통계 조건 필터링 - `batch_analyze_cases`: 일괄 분석 - `analyze_correlation`: 상관관계 분석 - `compare_groups`: 그룹 비교 - `detect_anomalies`: 이상치 탐지 - `time_window_analysis`: 시간 구간 분석 - `export_to_csv`: CSV 내보내기 ### 시각화 - `plot_multiple_cases`: 다중 케이스 플롯 (무제한) - `plot_distribution`: 분포 시각화 - `plot_scatter_correlation`: 산점도 상관관계 - `plot_heatmap`: 시간대별 히트맵 ## 📋 VitalDB 트랙 종류 ### 생체 신호 - `ECG_II`, `ECG_V5`: 심전도 - `PLETH`: 맥파 - `RESP`: 호흡 파형 ### 혈압 - `ART`: 동맥압 - `CVP`: 중심정맥압 - `PAP`: 폐동맥압 - `NIBP_SYS`, `NIBP_DIA`, `NIBP_MBP`: 비침습적 혈압 ### 산소/가스 - `SpO2`: 산소포화도 - `EtCO2`: 호기말 이산화탄소 - `FiO2`: 흡입산소농도 ### 마취/진정 - `BIS`: 뇌파지수 - `MAC`: 최소폐포농도 ### 기타 - `HR`: 심박수 - `RR`: 호흡수 - `TEMP`: 체온 ## 🔧 문제 해결 ### 1. MCP 서버가 연결되지 않는 경우 - Claude Desktop을 완전히 종료하고 재시작 - 설정 파일의 경로가 정확한지 확인 - Python 경로가 올바른지 확인 ### 2. VitalDB 다운로드 느린 경우 - 인터넷 연결 확인 - 샘플링 간격을 크게 설정 (예: interval=1.0) - 작은 케이스 수로 시작 ### 3. 패키지 오류 ```bash cd /Users/yeze-macbookair-2025/workspaces/vitaldb-mcp-server source venv/bin/activate pip install --upgrade -r requirements.txt ``` ## 📚 프로젝트 구조 ``` vitaldb-mcp-server/ ├── server.py # 메인 서버 (MCP 엔드포인트) ├── tools.py # 도구 정의 ├── handlers.py # 분석 기능 핸들러 ├── visualization.py # 시각화 핸들러 ├── utils.py # 유틸리티 함수 ├── requirements.txt # Python 의존성 ├── install.sh # 설치 스크립트 (Mac/Linux) ├── install.bat # 설치 스크립트 (Windows) └── README.md # 이 문서 ``` ## 🎓 학습 리소스 - [VitalDB 공식 문서](https://vitaldb.net/docs/) - [VitalDB 데이터셋 설명](https://vitaldb.net/dataset/) - [MCP 프로토콜](https://modelcontextprotocol.io) ## 📝 라이선스 MIT License --- **제작**: VitalDB MCP Server Advanced Edition **버전**: 2.0.0 **최종 업데이트**: 2025-10-07

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