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Obsidian Vault MCP

面向科研文献工作流的本地 MCP 服务:以 Zotero 管理来源,以 MinerU 提取全文,以 Obsidian 沉淀文献、Wiki 与结构化 Analysis,并通过 Skills 让 AI Agent 按可追溯流程工作。

English · 完整安装教程 · 开发文档 · 更新日志 · 贡献者

架构

用户自然语言任务
        ↓
7 个科研 Skills:识别意图、规划步骤、约束证据与输出
        ↓
31 个 MCP Tools:版本契约、查询、导入、解析、检索、校验与事务写入
        ↓
Zotero Desktop ── PDF ── MinerU ── Obsidian Vault
                                      ├─ Literature 主笔记
                                      ├─ PDF 与全文 Markdown
                                      ├─ Index / Literature.base
                                      ├─ Wiki
                                      └─ 五类 Analysis / Analysis.base

项目不绑定大模型供应商。MCP Tools 负责确定性的本地数据操作,Skills 负责把工具编排成可复用的科研工作流。

Related MCP server: zoty

核心功能

  • 稳定文献身份:以 Zotero 父条目 zoteroKey 作为主键。

  • Zotero 导入与同步:支持单篇、Collection、notes、annotations、BibTeX、存储附件和链接附件。

  • MinerU 全文解析:将 PDF 规范化为 Markdown,每篇文献使用独立图片目录和相对链接。

  • Obsidian 文献库:自动维护 Literature/index.mdLiterature/Literature.base、主笔记、PDF、全文和 Wiki。

  • 结构化研究层:支持 full_readliterature_reviewpassage_qafigure_qaconcept 五类 Analysis。

  • 统一数据库视图Literature/Analysis/Analysis.base 提供 9 个视图。

  • 科研 Skills:内置 paper-qafull-readpassage-qafigure-qacompare-papersliterature-reviewconcept-learning

  • 安全写入:支持 dry-run、staging、锁、备份、原子替换、事务预览和回滚。

  • 版本可验证literature_version 返回当前版本、31 个工具、7 个 Skills 和五类 Analysis。

  • 多客户端接入:支持 Codex、Claude Code、OpenCode、Pi、Hermes 和 WorkBuddy。

效果展示

文献目录

Literature Index

多篇文献形成的可追溯 Wiki

安装

3.0.1 已正式发布,要求 Python 3.10+。以下公开安装命令现已可用。

uv(推荐)

uv tool install "zotero-obsidian-mcp==3.0.1"
obsidian-vault-mcp --help

无需持久安装:

uvx --from "zotero-obsidian-mcp==3.0.1" obsidian-vault-mcp doctor --vault-path "<VAULT_PATH>"

pipx / pip

pipx install "zotero-obsidian-mcp==3.0.1"
# 或
python -m pip install "zotero-obsidian-mcp==3.0.1"

MCP Registry

io.github.luffysolution-svg/obsidian-vault-mcp

等价的 stdio 配置:

{
  "mcpServers": {
    "obsidian-literature": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "--from",
        "zotero-obsidian-mcp==3.0.1",
        "obsidian-vault-mcp",
        "serve",
        "--transport",
        "stdio"
      ],
      "env": {
        "OBSIDIAN_VAULT_PATH": "<VAULT_PATH>"
      }
    }
  }
}

首次配置

目标目录必须是已由 Obsidian 打开过的 Vault,并包含 .obsidian/

obsidian-vault-mcp config init --vault-path "<VAULT_PATH>" --dry-run
obsidian-vault-mcp config init --vault-path "<VAULT_PATH>"
obsidian-vault-mcp config validate --vault-path "<VAULT_PATH>"
obsidian-vault-mcp doctor --vault-path "<VAULT_PATH>"
obsidian-vault-mcp call literature_version --json '{}'

启动 Zotero Desktop 并启用本地 API:

obsidian-vault-mcp call zotero_search_items --json '{"query":"photocatalysis"}'
obsidian-vault-mcp import item ABCD1234 --vault-path "<VAULT_PATH>" --dry-run
obsidian-vault-mcp import item ABCD1234 --vault-path "<VAULT_PATH>"

链接附件配置:

{
  "zotero": {
    "linkedAttachmentBaseDir": "<ZOTERO_LINKED_ATTACHMENT_BASE_DIR>"
  }
}

MinerU 解析:

obsidian-vault-mcp mineru parse ABCD1234 --vault-path "<VAULT_PATH>" --dry-run
obsidian-vault-mcp mineru parse ABCD1234 --vault-path "<VAULT_PATH>"

规范产物:

Literature/attachment/MinerU/ABCD1234.md
Literature/attachment/MinerU/image/ABCD1234/ABCD1234-fig01.png

Agent 与插件安装

obsidian-vault-mcp agent install codex --dry-run
obsidian-vault-mcp agent install codex

客户端名称可替换为 claudeopencodepihermesworkbuddy

客户端

安装内容

Codex

原生 marketplace 插件、MCP 和 7 Skills

Claude Code

原生 marketplace 插件、MCP 和 7 Skills

OpenCode

项目本地 MCP 和 7 Skills

Pi

薄 TypeScript Extension

Hermes

MCP 配置

WorkBuddy

MCP 配置

GitHub Release 中的离线插件包:

obsidian-vault-mcp-3.0.1-plugins.zip

Skills

Skill

工作流

paper-qa

单篇快速问答,默认不写入 Vault

full-read

单篇完整精读并保存 full_read

passage-qa

定位具体段落、方法、数据或结论

figure-qa

解读图、表、Scheme 和方程

compare-papers

对用户选定论文建立可比性矩阵

literature-review

对文献池进行主题化综述

concept-learning

跨文献建立概念模型

正式工具面

分组

数量

版本、系统与配置

5

Zotero

6

导入与同步

4

MinerU

3

导航与校验

3

Analysis

5

Wiki

3

事务

2

合计

31

发布一致性

3.0.1 必须同时出现在 Python 包、运行时 __version__、MCP Registry server.json、Codex/Claude 插件清单、Pi 包、Git Tag v3.0.1、GitHub Release 和 PyPI 中。Release workflow 会校验版本、Tag 和产物身份,构建 wheel、sdist、插件 ZIP,执行测试与 handshake,并生成 SHA256SUMS

安全边界

  • 所有写操作先 dry-run,再提交并保存 transactionId

  • 不要提交 Vault 绝对路径、Zotero 数据目录、MinerU token 或其他凭据。

  • MinerU 可能把 PDF 发送到外部服务,使用前确认授权和组织政策。

  • 推荐本地 stdio;SSE/HTTP 必须放在可信认证边界之后。

  • 事务备份不替代独立的 Vault 备份。

贡献者

感谢 方珸 / Lym Fang (@LimFang) 提出 Zotero 链接附件兼容方案。完整记录见 CONTRIBUTORS.md

A
license - permissive license
-
quality - not tested
A
maintenance

Maintenance

Maintainers
6hResponse time
2dRelease cycle
37Releases (12mo)
Commit activity

Resources

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