MCP GitHub Issue Server
by sammcj
```text
atlas-mcp-server
├── .husky/
│ ├── _/
│ │ ├── .gitignore
│ │ ├── applypatch-msg
│ │ ├── commit-msg
│ │ ├── h
│ │ ├── husky.sh
│ │ ├── post-applypatch
│ │ ├── post-checkout
│ │ ├── post-commit
│ │ ├── post-merge
│ │ ├── post-rewrite
│ │ ├── pre-applypatch
│ │ ├── pre-auto-gc
│ │ ├── pre-commit
│ │ ├── pre-merge-commit
│ │ ├── pre-push
│ │ ├── pre-rebase
│ │ └── prepare-commit-msg
│ └── pre-commit
├── config/
│ ├── default.json
│ └── notes.json
├── examples/
│ ├── portfolio-website/
│ │ ├── prompt.md
│ │ ├── README.md
│ │ └── task-hierarchy-full.json
│ ├── templates_showcase/
│ │ ├── atlas-tasks.db
│ │ ├── tasks-2025-01-03.json
│ │ └── tasks-2025-01-03.md
│ └── README.md
├── notes/
│ ├── task-creation.md
│ ├── task-maintenance.md
│ └── task-update.md
├── scripts/
│ ├── build-utils.js
│ ├── generate-tree.js
│ ├── platform-utils.js
│ ├── postinstall.js
│ ├── prestart.js
│ └── set-build-permissions.js
├── src/
│ ├── config/
│ │ ├── config-initializer.ts
│ │ ├── config-manager.ts
│ │ ├── index.ts
│ │ └── README.md
│ ├── errors/
│ │ ├── base-error.ts
│ │ ├── config-error.ts
│ │ ├── error-factory.ts
│ │ ├── index.ts
│ │ ├── logging-error.ts
│ │ ├── README.md
│ │ ├── storage-error.ts
│ │ ├── task-error.ts
│ │ └── tool-error.ts
│ ├── events/
│ │ ├── batch-processor.ts
│ │ ├── event-manager.ts
│ │ ├── health-monitor.ts
│ │ └── README.md
│ ├── logging/
│ │ ├── error-formatter.ts
│ │ ├── file-transport.ts
│ │ ├── health-monitor.ts
│ │ ├── index.ts
│ │ ├── logger.ts
│ │ ├── README.md
│ │ ├── transaction-logger.ts
│ │ └── transport-manager.ts
│ ├── notes/
│ │ ├── index.ts
│ │ ├── note-manager.ts
│ │ └── notes-initializer.ts
│ ├── server/
│ │ ├── health-monitor.ts
│ │ ├── index.ts
│ │ ├── metrics-collector.ts
│ │ ├── rate-limiter.ts
│ │ ├── README.md
│ │ └── request-tracer.ts
│ ├── storage/
│ │ ├── base/
│ │ │ └── base-storage.ts
│ │ ├── connection/
│ │ │ ├── pool/
│ │ │ │ ├── connection-pool.ts
│ │ │ │ ├── index.ts
│ │ │ │ ├── sqlite-connection-factory.ts
│ │ │ │ ├── sqlite-connection.ts
│ │ │ │ └── types.ts
│ │ │ ├── index.ts
│ │ │ └── manager.ts
│ │ ├── core/
│ │ │ ├── connection/
│ │ │ │ ├── health.ts
│ │ │ │ ├── manager.ts
│ │ │ │ ├── pool.ts
│ │ │ │ └── state.ts
│ │ │ ├── query/
│ │ │ │ ├── builder.ts
│ │ │ │ ├── executor.ts
│ │ │ │ └── optimizer.ts
│ │ │ ├── schema/
│ │ │ │ ├── backup.ts
│ │ │ │ ├── migrations.ts
│ │ │ │ └── validator.ts
│ │ │ ├── transactions/
│ │ │ │ ├── coordinator.ts
│ │ │ │ ├── manager.ts
│ │ │ │ └── scope.ts
│ │ │ ├── wal/
│ │ │ │ ├── checkpoint-manager.ts
│ │ │ │ ├── file-handler.ts
│ │ │ │ ├── index.ts
│ │ │ │ ├── manager.ts
│ │ │ │ ├── metrics-collector.ts
│ │ │ │ └── types.ts
│ │ │ └── index.ts
│ │ ├── factory/
│ │ │ └── error-handler.ts
│ │ ├── interfaces/
│ │ │ ├── config.ts
│ │ │ ├── storage.ts
│ │ │ ├── template-storage.ts
│ │ │ └── types.ts
│ │ ├── monitoring/
│ │ │ ├── health.ts
│ │ │ ├── index.ts
│ │ │ └── metrics.ts
│ │ ├── query/
│ │ │ ├── builder/
│ │ │ │ ├── query-builder.ts
│ │ │ │ └── sqlite-query-builder.ts
│ │ │ ├── optimizer/
│ │ │ │ ├── index.ts
│ │ │ │ └── sqlite-optimizer.ts
│ │ │ ├── executor.ts
│ │ │ └── index.ts
│ │ ├── sqlite/
│ │ │ ├── database/
│ │ │ │ ├── connection.ts
│ │ │ │ └── schema.ts
│ │ │ ├── metrics/
│ │ │ │ └── storage-metrics.ts
│ │ │ ├── operations/
│ │ │ │ └── task-operations.ts
│ │ │ ├── config.ts
│ │ │ ├── error-handler.ts
│ │ │ ├── index.ts
│ │ │ ├── init.ts
│ │ │ ├── storage.ts
│ │ │ └── template-storage.ts
│ │ ├── utils/
│ │ │ ├── index.ts
│ │ │ ├── storage-error-handler.ts
│ │ │ └── storage-path-utils.ts
│ │ ├── factory.ts
│ │ ├── index.ts
│ │ └── README.md
│ ├── task/
│ │ ├── core/
│ │ │ ├── batch/
│ │ │ │ ├── common/
│ │ │ │ │ └── batch-utils.ts
│ │ │ │ ├── services/
│ │ │ │ │ ├── dependency-validation-service.ts
│ │ │ │ │ └── status-transition-service.ts
│ │ │ │ ├── base-batch-processor.ts
│ │ │ │ ├── index.ts
│ │ │ │ ├── README.md
│ │ │ │ └── unified-batch-processor.ts
│ │ │ ├── cache/
│ │ │ │ ├── cache-coordinator.ts
│ │ │ │ ├── cache-manager.ts
│ │ │ │ ├── cache-metrics.ts
│ │ │ │ ├── index.ts
│ │ │ │ └── resource-cache-manager.ts
│ │ │ ├── indexing/
│ │ │ │ ├── index-manager.ts
│ │ │ │ └── index.ts
│ │ │ ├── transactions/
│ │ │ │ ├── index.ts
│ │ │ │ ├── task-transaction-manager.ts
│ │ │ │ └── transaction-manager.ts
│ │ │ ├── error-handler.ts
│ │ │ ├── index.ts
│ │ │ ├── status-state-machine.ts
│ │ │ ├── task-resource-handler.ts
│ │ │ └── task-store.ts
│ │ ├── manager/
│ │ │ ├── error-handler.ts
│ │ │ ├── index.ts
│ │ │ ├── task-cache-manager.ts
│ │ │ ├── task-event-handler.ts
│ │ │ └── task-manager.ts
│ │ ├── operations/
│ │ │ ├── index.ts
│ │ │ └── task-operations.ts
│ │ ├── validation/
│ │ │ ├── schemas/
│ │ │ │ ├── base-schema.ts
│ │ │ │ ├── bulk-operations-schema.ts
│ │ │ │ ├── create-schema.ts
│ │ │ │ ├── index.ts
│ │ │ │ ├── metadata-schema.ts
│ │ │ │ ├── task-schemas.ts
│ │ │ │ └── update-schema.ts
│ │ │ ├── validators/
│ │ │ │ ├── dependency-validator.ts
│ │ │ │ ├── hierarchy-validator.ts
│ │ │ │ ├── index.ts
│ │ │ │ └── status-validator.ts
│ │ │ ├── index.ts
│ │ │ └── task-validator.ts
│ │ └── README.md
│ ├── template/
│ │ ├── interpolation/
│ │ │ ├── metadata-transformer.ts
│ │ │ └── variable-interpolator.ts
│ │ ├── loader/
│ │ │ ├── template-loader.ts
│ │ │ └── template-validator.ts
│ │ ├── validation/
│ │ │ └── schemas/
│ │ │ └── template-schemas.ts
│ │ ├── manager.ts
│ │ └── README.md
│ ├── tools/
│ │ ├── definitions/
│ │ │ ├── tools/
│ │ │ │ ├── shared/
│ │ │ │ │ ├── response-formatter.ts
│ │ │ │ │ └── types.ts
│ │ │ │ ├── agent-builder-tool.ts
│ │ │ │ ├── index.ts
│ │ │ │ ├── task-creation.ts
│ │ │ │ ├── task-deletion.ts
│ │ │ │ ├── task-maintenance.ts
│ │ │ │ ├── task-operations.ts
│ │ │ │ ├── task-queries.ts
│ │ │ │ ├── task-update.ts
│ │ │ │ └── template-tools.ts
│ │ │ ├── agent-builder.ts
│ │ │ └── tool-definitions.ts
│ │ ├── error-handler.ts
│ │ ├── handler.ts
│ │ ├── index.ts
│ │ ├── README.md
│ │ ├── schemas.ts
│ │ ├── session-schemas.ts
│ │ ├── types.ts
│ │ └── utils.ts
│ ├── types/
│ │ ├── batch.ts
│ │ ├── cache.ts
│ │ ├── config.ts
│ │ ├── error.ts
│ │ ├── events.ts
│ │ ├── index.ts
│ │ ├── indexing.ts
│ │ ├── logging.ts
│ │ ├── lru-cache.d.ts
│ │ ├── notes.ts
│ │ ├── project.ts
│ │ ├── README.md
│ │ ├── session.ts
│ │ ├── storage.ts
│ │ ├── task-core.ts
│ │ ├── task-metadata.ts
│ │ ├── task-types.ts
│ │ ├── task.ts
│ │ ├── template.ts
│ │ ├── tool.ts
│ │ └── transaction.ts
│ ├── utils/
│ │ ├── date-formatter.ts
│ │ ├── error-utils.ts
│ │ ├── id-generator.ts
│ │ ├── path-utils.ts
│ │ ├── pattern-matcher.ts
│ │ ├── platform-utils.ts
│ │ └── README.md
│ ├── validation/
│ │ ├── core/
│ │ │ ├── config/
│ │ │ │ └── schema.ts
│ │ │ ├── id/
│ │ │ │ └── schema.ts
│ │ │ ├── path/
│ │ │ │ └── schema.ts
│ │ │ ├── constants.ts
│ │ │ └── index.ts
│ │ ├── config.ts
│ │ ├── id-schema.ts
│ │ ├── index.ts
│ │ └── README.md
│ ├── visualization/
│ │ ├── formatters/
│ │ │ ├── base-formatter.ts
│ │ │ ├── index.ts
│ │ │ ├── json-formatter.ts
│ │ │ └── markdown-formatter.ts
│ │ ├── index.ts
│ │ ├── README.md
│ │ ├── task-visualizer.ts
│ │ └── visualization-manager.ts
│ └── index.ts
├── templates/
│ ├── software_engineer/
│ │ ├── devops_engineer.json
│ │ ├── product_designer.json
│ │ ├── security_engineer.json
│ │ ├── system_architect.json
│ │ ├── team.json
│ │ └── tech_lead.json
│ ├── README.md
│ └── web-project.json
├── .eslintrc.json
├── .gitignore
├── .prettierrc
├── eslint.config.js
├── LICENSE
├── package.json
├── README.md
├── repo-tree.md
├── storage-refactor.md
└── tsconfig.json
```