act_qpcr_ddct
【qPCR 相对表达量(2^-ΔΔCt)】 用户给出目的基因与内参基因的 Ct 值(对照组/处理组各若干重复),要算 ΔCt、ΔΔCt、2^-ΔΔCt 相对表达量或倍数、并做组间检验时,必须走这个动作。🔴 严禁自己心算 ΔΔCt 与倍数:校准必须用对照组 ΔCt 的均值(不是某一个对照样本的值,用了单样本会整体偏高/偏低);且统计检验要由引擎判断(组内零方差时 Welch t 会给出虚高的 P 值,引擎会改用 Mann-Whitney)。返回里 stat_method / tested_variable 必须如实转述。Ct 值用逗号分隔,两组与各自内参一一对应。 返回:fc(2^-ΔΔCt 相对倍数,已按对照组 ΔCt 均值校准)、fold_values、p_value、stat_method(welch_ttest_on_dct / student_ttest_on_dct / mann_whitney)、tested_variable(固定 delta_ct)、dct、significance、outlier_check (真实算法引擎执行,非大模型生成)
Input Schema
| Name | Required | Description | Default |
|---|---|---|---|
| gene | No | 目的基因名,如 NLRP3 / TREM2 | |
| exp_ct | Yes | 处理组目的基因 Ct,逗号分隔,如 20.1,20.4,20.2 | |
| ctrl_ct | Yes | 对照组目的基因 Ct,逗号分隔,如 22.5,22.8,22.6 | |
| ref_gene | No | 内参基因名,默认 GAPDH | |
| exp_ref_ct | Yes | 处理组内参基因 Ct,逗号分隔,与 exp_ct 一一对应,如 18.2,18.5,18.3 | |
| ctrl_ref_ct | Yes | 对照组内参基因 Ct,逗号分隔,与 ctrl_ct 一一对应,如 18.3,18.1,18.4 |